Se analizó el pedigrí en diez razas de ovinos mediante parámetros genéticos poblacionales. Las poblaciones fueron Blackbelly (BBL; 19,695), Charollais (CHA; 5,033), Dorper (DOR; 42,171), Dorper Blanco (DOB; 4,213), Dorset (DOS; 5,557), Hampshire (HAM; 12,210), Katahdin (KAT; 77,955), Pelibuey (PEL; 42,256), Rambouillet (RAM; 11,951) y Suffolk (SUF; 14,099); nacidos de 1992 a 2018. Los análisis se realizaron con el software Endog. En padres conocidos, los valores oscilaron de 76.4 % (SUF) a 95.3 % (KAT), con promedio general de 86.0%, los animales con padres desconocidos correspondieron a los fundadores. La población consanguínea (como porcentaje de la población total) fluctuó del 12.3 % en DOS al 48.7 % en DOB, con promedio general de 29.7 %; la consanguinidad (F) promedio osciló de 3.9 (KAT) a 14.6 (DOB), con promedio general de 8.0. La evolución de F y sus componentes fue: en todas las poblaciones, la proporción de consanguíneos se incrementó (P<0.05); los niveles de relación genética (RG) son estables; y, la F presentó tendencias negativas (P<0.05). KAT, DOB y BBL con altas tasas de crecimiento en población consanguínea; DOB y DOS, DOB y CHA con los niveles más altos de F y RG, respectivamente. Seis poblaciones presentaron tamaño efectivo (Ne) mayor a 50; el resto presentaron Ne menor a 37, lo cual señala el estatus de cuidado para monitorear la evolución de F y sus posibles implicaciones. El intervalo generacional (IG) osciló de 3.0 a 4.15, con promedio general de 3.45 años, los mayores IG fueron para RAM y SUF, BBL y DOR con IG menores.

En cerdo pelón mexicano se analizó el pedigrí (n = 305), 16 variables morfológicas (VARMOR; n = 201) y 74 marcadores genéticos (SNP; n = 107) de uso en pruebas de paternidad. Se calculó: ancestros fundadores; tamaño efectivo (Ne); consanguinidad; intervalo generacional (IG); estadísticos F de Wright (FST, FIS y FIT). Las VARMOR fueron: longitud de cabeza, ancho de cabeza, longitud de hocico, ancho de hocico, longitud de oreja, ancho de orejas, distancia entre orbitales, altura a la cruz, ancho de pecho, circunferencia de pecho, longitud de cuello, ancho de cuello, perímetro de caña, longitud de cuerpo, ancho de pelvis, perímetro abdominal; se analizaron con el modelo mixto: y = μ + si + gj + β1 + β2 + mad + ε, donde: y, variable respuesta; μ, media; si, sexo; gj, granja; β1 y β2, lineal y cuadrático de la covariable edad del individuo; mad, efecto aleatorio de la madre; ε, residuales. Con la matriz de correlaciones se realizó un análisis de componentes principales. En los SNP se estimó el contenido de información polimórfica (PIC) y sus componentes, así como las probabilidades de no exclusión combinada (PNE). Ne = 92.10; ancestros que explican el 50% del pedigrí = 7; porcentaje de animales consanguíneos = 2.3%; consanguinidad promedio = 0.11%; IG promedio = 1.69 años. FST = 7%; FIS y FIT de -0.083 y -0.006, respectivamente. El mad explicó, en promedio, el 54.3% de la variabilidad. Para PIC, el promedio fue de 0.266 con valores en el intervalo de 0.018 a 0.375; las PNE fueron en el intervalo de 0.007 a 3.1E-22.

Con el objetivo de definir el panel de polimorfismos de nucleótido simple (SNP) para pruebas de paternidad en bovinos, se analizaron los genotipos en tres razas (número de SNP evaluados e individuos muestreados): Hereford (HER; 202; 1317), Brangus (BRA; 217; 3431) y Limousin (LIM; 151; 8205). Dentro de raza, se descartó los SNP con porcentaje de individuos genotipados (PIG) menor a 90 %, con desequilibrio Hardy Weinberg (HW; P<0.05), con frecuencia de alelo menor de 0.10 o menos y con desequilibrio de ligamiento, donde la correlación entre frecuencias genotípicas fue superior a 0.25. Se estimó los niveles de heterocigosis esperada (He) y observada (Ho), contenido de información polimórfica (CIP); así como, el índice de Shannon, el índice de fijación y tamaño efectivo de población (Ne). Se calculó la probabilidad de exclusión (PEC) y de identidad combinada (PIC). El panel final fue de 121, 188 y 113 SNP en HER, BRA y LIM, respectivamente; la principal fuente de descarte fue HW seguido de PIG. Los niveles de Ho y He fueron superior a 0.40; el PIC fue mayor a 0.32 y Ne presentó estimaciones por arriba de 181.3. Los resultados para la PEC fueron superiores a 0.999999; para la PIC, estuvieron por debajo de 1 x 10-20.