Η διδακτορική διατριβή εντάσσεται στην έρευνα των διαμεμβρανικών πρωτεϊνών μεταφοράς, οι οποίες (α) συνιστούν μεγάλο αριθμό γονιδιακών προϊόντων σε όλα τα είδη οργανισμών (5-15%), (β) δεν έχουν μελετηθεί επαρκώς στο παρελθόν, λόγω περιορισμένης παραγωγής αναλυτικών τρισδιάστατων δομών από κρυσταλλογραφία, (γ) υπόκεινται σε μηχανισμούς λειτουργίας και εξειδίκευσης που μόλις αρχίζουν να γίνονται κατανοητοί σε αναλυτικό επίπεδο. Πρωτεΐνες του τύπου αυτού όπως ο μεταφορέας σεροτονίνης ή ο συμμεταφορέας γλυκόζης-νατρίου είναι σημαντικές για την ανθρώπινη φυσιολογία και παθογένεση, συνδέονται με την αιτιολογία ή εξέλιξη σημαντικών γενετικών νόσων (π.χ. κυστική ίνωση, Parkinson’s, Alzheimer’s) ή αποτελούν στόχους ορισμένων από τα συχνότερα συνταγογραφούμενα φάρμακα (π.χ. Prozac, Prilosec). Συγκεκριμένα στην διατριβή αναλύονται με τεχνικές κυστεϊνικής σάρωσης (Cys-scanning) η δομική και λειτουργική οργάνωση ενός τυπικού μεταφορέα πουρινών της οικογένειας NAT/NCS2 (nucleobase-cation symporters), ονόματι XanQ, τον οποίο έχουμε κλωνοποιήσει και χαρακτηρίσει πρόσφατα στο εργαστήριό μας. Εφαρμόζονται πειράματα διασταυρωτής σύνδεσης (cross-linking) και λειτουργικής ανάλυσης διπλών μεταλλαγμάτων, παρουσία και απουσία υποστρώματος. Ως αποτέλεσμα δίνεται ένα πειραματικό μοντέλο οργάνωσης των διαμεμβρανικών τμημάτων (α-ελίκων) στην τριτοταγή δομή του XanQ, καταγράφονται οι αλλαγές διαμόρφωσης που χαρακτηρίζουν τον μηχανισμό δέσμευσης/μεταφοράς ξανθίνης, εντοπίζονται κατάλοιπα πλησίον του κέντρου δέσμευσης ή σε θέσεις–«αισθητήρες» για τις αλλαγές διαμόρφωσης που επάγει η δέσμευση υποστρώματος, σύμφωνα και με δεδομένα που προκύπτουν από την πρώτη δημοσιευμένη κρυσταλλογραφική δομή του ομολόγου μεταφορέα της ουρακίλης της οικογένειας UraA. Πρόκειται για την πρώτη συστηματική ανάλυση αυτού του τύπου σε μια σημαντική, εξελικτικά συντηρημένη οικογένεια μεμβρανικών πρωτεϊνών που χρησιμοποιεί ως υποστρώματα πολλά δομικά ανάλογα φαρμάκων, και δεν έχει αναλυθεί έως σήμερα διεξοδικά σε υψηλή ευκρίνεια.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.