Esta pesquisa teve como objetivo verificar o efeito da prática de natação de 12 semanas sobre escores de saúde mental em indivíduos com amputação. Participaram do estudo 19 indivíduos entre 30 e 66 anos, separados em grupo 1: não amputados (n=12) e grupo 2: amputados (n=7), ambos submetidos ao programa de natação com frequência de duas vezes por semana. Foram realizadas avaliação de depressão/ansiedade utilizando os inventários de Beck, e de autoestima utilizando o questionário de autoimagem/autoestima proposto por Steglich, antes e após o programa de natação utilizando o teste estatístico de Tukey. Os escores de ansiedade (p<0.05) de ambos os grupos apresentaram redução (não amputados: 6.33±3.4; amputados: 6.76±2.4), quando comparado ao pré-programa (não amputados: 10.6±2.4; amputados: 11.7±2.6). Em relação à autoestima, apenas o grupo de amputados teve aumento (181±8.6) significativo (p<0.05), quando comparados ao pré-programa (146±4.0). Conclui-se que o programa de 12 semanas de natação foi eficaz para a melhora de parâmetros de ansiedade e autoestima em pessoas com amputação.