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El análisis de firmas espectrales es uno de los métodos de diagnóstico más utilizados para identificar enfermedades en las plantas. Con este fin, se deben considerar diferentes técnicas de adquisición de información para detectar los diferentes niveles de una enfermedades o plaga en particular, como en el caso de las enfermedades fúngicas. En este estudio, se consideraron plantas cucúrbitas en las cuales se identificaron tres etapas de niveles de una enfermedad fúngica que son las hojas en la etapa de germinación del hongo, hojas con primeros síntomas y hojas enfermas. Se utilizó una base de datos con firmas espectrales de hojas de calabacita. A continuación, se propone el análisis de frecuencia de las características espectrales utilizando la transformada de Fourier para extraer características de los coeficientes obtenidos y partir de bloques de clasificación con máquinas de vectores de soporte para la estimación del nivel de daño. Se demostraron precisiones de clasificación del 98.3%. Por lo tanto, este método se puede utilizar para diagnosticar el grado de daño en diferentes cultivos.