A virtualização por contêineres vem ganhando popularidade nos últimos anos devido à criação de ambientes virtuais isolados com uma alocação eficiente de recursos computacionais para a execução de aplicações considerando o compartilhamento de recursos. Este trabalho tem por objetivo verificar se esta melhoria é sempre possível através da comparação do uso de contêineres e máquinas virtuais para a execução de uma aplicação científica de biodiversidade usado em um serviço de nuvem. Em particular, sua eficiência na escalabilidade desses ambientes virtuais em Computação de Alta Vazão é analisada.