Las infecciones de pie diabético (IPD) son un problema de salud mundial. En México, 128 mil amputaciones se llevaron a cabo por pie diabético en el 2016, generando altos costos económicos. Esto debido en parte a que la identificación de las bacterias en las IPD es un proceso que puede llevar varios días por métodos microbiológicos, además, podrían generar un sesgo ya que los agentes patógenos podrían no ser identificados en su totalidad. Adicionalmente, los cultivos se enfocan generalmente al estudio de bacterias aerobias, dejando de lado el grupo de anaerobios, por lo cual su papel en estas infecciones es controversial. Los métodos moleculares permiten la detección indirecta de las bacterias anaerobias, de modo que es posible estimar su prevalencia. El objetivo de este trabajo fue detectar la presencia de Bacteroides fragilis en biopsias de infecciones de pie diabético mediante PCR. El 11.6% de las muestras resultaron positivas lo que indica que existe una prevalencia relevante de esta bacteria en dichas infecciones, de modo que podría tomar parte en el desarrollo de dichas infecciones y representar un riesgo para los pacientes.