La cadena logística es el proceso desde el aprovisionamiento de la materia prima para ser planificado, implementado para ser terminado y que cumpla con todas las características de calidad en el desarrollo de dos escenarios como almacenamiento y transporte. El presente estudio tuvo como  finalidad estudiar el proceso de selección de banano orgánico, lo cual genera causas que producen el deterioro y mal manejo de transportación interna hasta al puerto de embarque que produce daño a la fruta. De esta manera se implemento una investigación no experimental y transversal a través del aporte práctico y de campo, también se lleva a cabo la entrevista al jefe encargado de la empresa para la recopilación de datos de manera confiable sobre el banano rechazado en la cadena logística. Entre los principales hallazgos se constató en el centro de acopio de los pequeños productores de banano: bajo rendimiento de producción; disminución de ventas y oferta exportable. Otros factores que afectan al rechazo de la fruta provienen del productor por desconocimiento de la producción y malas prácticas del enfundado que produce la merma del banano, lo que significa un amplio margen de perdida en el proceso de comercialización. Como conclusión final se requiere elaborar estrategias en la cadena logística que fueron determinadas como factores principales en el diagrama de Ishikawa con la finalidad de reducir el banano rechazado en la asociación.