En el presente documento se aborda, desde un aspecto metódico y cualitativo, una propuesta desde la contabilidad ambiental (CA) para la toma de decisiones en la gestión del agua y de la energía en la Pontificia Universidad Javeriana – sede central, desarrollada en tres fases principales que son: i) la Medición, ii) la Evaluación y iii) la Comunicación. La primera fase se desarrolla a partir de la revisión de la gestión del agua y de la energía en la Pontificia Universidad Javeriana (PUJ), y del plan de manejo ecológico y ambiental; para de esta manera, estructurar la Matriz de Marco Contable la cual permite organizar la información, uniendo los datos sobre la gestión del agua y la energía con variables financieras. En la segunda fase de Evaluación, se presenta una ruta para plantear diez indicadores de sostenibilidad del desarrollo con sus respectivas hojas metodológicas; los cuales brindan de manera objetiva información para la toma de decisiones en la PUJ en la gestión del agua y la energía. En la tercera fase, la Comunicación, se plantean las estrategias, conjugando los resultados de la Matriz de Marco Contable y los indicadores, para abordar la acción comunicativa en la toma de decisiones. Finalmente, se presentan aportes desde la CA, para contribuir al proceso contable y ambiental de la PUJ.