El uso de herramientas didácticas en la enseñanza en los cursos de bachillerato puede significar una decisión contundente para las mejoras en el aprendizaje efectivo de los estudiantes, así como su motivación para afrontar los retos académicos propios de esta fase escolar. En este trabajo se ha analizado el uso de organizadores gráficos para la enseñanza de las teorías atómicas en el estudio de la química inorgánica. Para ello se utilizó una muestra de 150 estudiantes, divididos en dos grupos de trabajo, con el fin de que uno sea el grupo de control y otro el grupo experimental. Los principales resultados muestran que el uso de organizadores gráficos facilita la comprensión del contenido estudiado y además fortalece el desarrollo de habilidades como la síntesis, organización de ideas, coherencia de trabajo y creatividad.