A large collection of coffee genetic resources is conserved in Costa Rica. In this study, microsatellite DNA fingerprinting of coffee through singleplex and multiplex PCR approaches coupled with capillary electrophoresis are described. To validate both methods, germplasm of Coffea spp. (Arabica and non-Arabica) and intraspecific F1 hybrids were analyzed using fourteen microsatellite markers. It was observed that through both PCR methods the fingerprinting profile of a subset of samples was identical. The genetic analyses revealed that non-Arabica coffee displayed greater genetic variation than Arabica coffee did. In addition, microsatellite analyses allowed the separation of C. arabica from other species using the principal coordinate analysis (PCoA) approach. The neighbor-joining tree clustering analysis revealed either a grouping of wild genotypes separated from cultivars of C. arabica, or a relation of intraspecific F1 hybrids with parental lines. The utility of our methodology for the characterization of F1 hybrids not previously analyzed through SSR (Simple Sequence Repeats) fingerprinting is demonstrated.

Introducción. La guayaba es uno de los principales frutales de la familia Myrtaceae por su alto valor nutricional. Es originario de América tropical y los principales países productores son: México, India, Brasil y Tailandia. El interés generado en los últimos años por el mejoramiento genético de este cultivo, ha propiciado el empleo de herramientas moleculares que permitan determinar la variabilidad genética y seleccionar genes de interés agronómico de una forma rápida y confiable. Sin embargo, el aislamiento de ADN de alta pureza es un requisito previo para poder emplear las técnicas moleculares de última generación. Objetivo. Aislar ADN genómico (ADNg) de alta calidad de guayaba, en cantidad e integridad adecuados. Materiales y métodos. El experimento se realizó en el Laboratorio de Biología Molecular de la Estación Experimental Agrícola Fabio Baudrit Moreno, entre enero y diciembre del 2019. Se compararon tres métodos diferentes para aislar ADN: Promega (ReliaPrep™ gDNA Tissue Miniprep Kit), Qiagen (DNeasy Plant Mini Kit) y CTAB (Doyle y Doyle, 1990) con modificaciones. Para la extracción de ANDg se utilizó material fresco y liofilizado de hojas jóvenes de guayaba (Psidium guajava L.; 2n = 22). Para determinar el mejor método se midieron la calidad, cantidad e integridad del ADNg de cada uno. Resultados. Se logró obtener ADNg con los tres métodos evaluados, los mejores resultados en cantidad de ADNg (ng μl-1) se obtuvieron con el material liofilizado y con el método CTAB. Los métodos CTAB y Qiagen mostraron mayor grado de pureza (relaciones A260/280 con valores óptimos) en comparación con el método Promega. Conclusión. Se logró obtener ADNg en cantidad, calidad e integridad adecuada. Esto se logró con base en extracciones en tejido liofilizado de hojas jóvenes y con el método de extracción del kit de Qiagen.