Se realizó una estandarización del método de extracción de ADN para cañihua (Chenopodium pallidicaule Aellen) y la caracterización molecular mediante marcadores moleculares ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Se utilizaron hojas de 40 accesiones de cañihua tomadas del banco de germoplasma del Programa de Cereales y Granos Nativos de la UNALM provenientes de dos provincias de Puno. Se realizó la extracción del ADN mediante el método CTAB. La agregación de cloroformo: alcohol isoamílico (24:1) y del etanol 96% permitieron la extracción de ADN de buena calidad. Obtenido el ADN, se realizó la amplificación PCR, PAGE y tinción con nitrato de plata. Se evaluó el porcentaje de loci polimórficos, contenido de información polimórfica y análisis de variancia molecular. Se seleccionaron 7 cebadores que produjeron 52 locus polimórficos de 144 marcadores ISSR, siendo los más informativos 841, 812, 810, 834 y BOR2. Una alta diferenciación genética entre poblaciones fue detectada basada en el AMOVA (Fst = 0.1544). Esto hace suponer que, la posición geográfica marca la diferenciación genética entre poblaciones de diferentes provincias.

El objetivo de esta investigación fue caracterizar siete accesiones de Tarwi (Lupinus mutabilis Sweet), provenientes del banco de germoplasma del INIA. Se utilizaron marcadores moleculares de inter-repeticiones de secuencia simple (ISSR), seleccionándose 10 iniciadores para amplificar el ADN de 91 individuos (semillas) en estudio, 13 por accesión, detectándose un total de 247 loci. Estos iniciadores fueron altamente informativos con un contenido de información polimórfica (PIC) promedio de 0.33. El principal factor de flujo genético in situ, entre estas accesiones, fue el intercambio o venta de semillas en ferias o mercados aledaños a la zona de colecta, debido a lo agreste de estos lugares. La predominante polinización autógama de L. mutabilis y la agrupación de las accesiones en el fenograma basado en el análisis de similitud, mostraron la alta probabilidad del incremento de alogamia durante la regeneración del cultivo, considerándose uno de los principales factores de flujo genético durante este periodo.