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Next generation sequencing technologies have noticeably improved in the last decade. Time and cost of whole genome sequencing are important challenges that must be reduced, opening unprecedented opportunities to various research and development areas. The alignment or mapping of small reads produced by sequencing machines to reference genomes of billions of nucleotides is a fundamental task in this sequencing process. It is computationally highly demanding and has become the bottleneck of the DNA analysis process. This paper proposes hardware acceleration based on FPGA of the Myers bit-parallelized algorithm, appropriately modified to be used in the extend stage of DNA alignment tools. The proposed design can be employed in conjunction with software functions, as it constitutes an extremely fast heterogeneous DNA alignment system. The implementation results show a speedup of up to [Formula: see text] relative to a sequential implementation only in software. In addition, due to the limited use of FPGA resources and the modular design, multiple modules can be used to completely populate the chip, further increasing the computing speed.

Aplicación de realidad aumentada centrada en el niño como recurso en un ambiente virtual de aprendizaje Augmented reality application centered on the child as a resource in a virtual learning

Los beneficios atribuidos a la realidad aumentada (RA) en la enseñanza de diferentes campos del conocimiento, han propiciado la intersección de modalidades y métodos de enseñanza aprendizaje que buscar potencializar las fortalezas de dicha tecnología aplicada en la educación. Uno de estos enfoques, entrelaza a la realidad aumentada con el aprendizaje móvil y con el aprendizaje basado en las simulaciones. No obstante, el cómo desarrollar estas aplicaciones a fin que permitan proporcional una experiencia de aprendizaje, es una línea que continúa construyéndose. En este artículo se presentan las fases de desarrollo de un simulador en realidad aumentada móvil, cuya formulación parte de la experiencia de un grupo de estudiantes al usar un simulador web. Además, se presentan los resultados de la evaluación de la calidad de los objetos de realidad aumentada, obteniendo una valoración positiva en los aspectos técnicos, de utilización y guía, lo que sugiere una integración adecuada de tecnología de realidad aumentada con los aspectos pedagógicos considerados en el diseño de la aplicación.