Karbapenem dirençli Enterobacteriaceae (KRE)'nin neden olduğu enfeksiyonlar, küresel sağlık için ciddi bir sorundur. Karbapenemler, kapsamlı uygulamaları nedeniyle günümüzde direnç mekanizmaları gelişmiştir. Karbapenemaz sentezleyen izolatların saptanması, dağılımlarının takip edilmesi ve uygun tedavinin sağlanabilmesi açısından oldukça önemlidir. Günümüz ilaç direncinin saptanmasında Real-time-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PZR), başta olmak üzere çeşitli ticari moleküler tanı yöntemleri kullanılmaktadır. Ancak testlerin yapılabilmesi için pahalı ekipmanlara ihtiyaç duyulması nedeni ile, rutin bakteriyoloji laboratuvarlarında uygulanabilecek güvenilir, pratik ve düşük maliyetli testlere ihtiyaç duyulmaktadır.Bu çalışma, Etlik İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde çeşitli servislerde yatan hastalardan izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) pozitif, karbapenemlere dirençli dirençli, kolistine duyarlı toplam 60 Gram-negatif bakteri (39 suş Acinetobacter baumannii (A. baumannii), 11 suş Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae ve 10 suş Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa))' de izolatın mcr-1 ve bla OXA-48 gen bölgelerinin varlığını belirlemek amacıyla yapılmıştır. Klinik örnekler konvansiyonel yöntemler ile izole edildikten sonra kesin tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testleri otomatize sistemle çalışılmıştır.GSBL ve kolistin direncinin doğrulanması disk difüzyon testi ve gradyen testleri ile yapıldı. PZR sonuçlarına göre A. baumannii suşunun 10 tanesinde, K. pneumoniae suşunun bir tanesinde ve P. aeruginosa suşunun bir tanesinde mcr-1 geni saptandı. A. baumannii suşunun 5 tanesinde, K. pneumoniae suşunun 2 tanesinde bla OXA-48 geni saptandı. A. baumannii suşunun bir tanesinde her iki genin varlığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak, karbapenemaz enzimi üretimi ve gen bölgesinin belirlenmesinde hızlı, tekrarlanabilir ve yüksek doğrulukta yeni tanı yöntemlerine ihtiyaç duyulmaktadır.

Öz Purpose:The aim of this study as to compare microscopy and culture results of samples, determine drug resistance rates of the isolates, evaluate epidemiological relationship between the strains with ERIC-PCR, RAPD-PCR, OUT-PCR based on in house PCR technique. Materials and Methods: Direct microscopy and culture results of 2010 samples were analyzed. Drug sensitivity results were obtained from TULSA. The typing of isolates based on in house PCR was carried out in the microbiology laboratory of a faculty of medicine in a state university. Results: Of positive samples, 2.68% had Acid-resistant bacilli (ARB) positive + culture positivity, 2.93% had ARB positive and culture negative in smear, and 1.34% had ARB negative and culture positivity in smear. Resistance to primary antituberculous (anti-TB) drugs wasn't observed in 33 culture positive isolates, whereas resistance to one or more primary anti-TB drugs was observed in 9.09%. Single drug resistance was 3.03%, resistance to Isoniazid (INH) and INH critical drugs was 6.06%. Isolates were divided 3 groups by ERIC-PCR, 5 groups for OUT-PCR and 6 by RAPD-PCR. Conclusion: Positivity rates were low due to low rate of studied samples, negative samples taken during treatment process. Molecular techniques like ERIC-PCR, RAPD-PCR and OUT-PCR are easy, fast and inexpensive methods for the epidemiological typing of Mycobacterium tuberculosis (MTB) in evaluating distinctions, similarities between origins. Amaç: Örneklerin mikroskopi ve kültür sonuçlarının karşılaştırılması, izolatların ilaç direnç oranlarının belirlenmesi, suşlar arasındaki epidemiyolojik ilişkilerin ERIC-PCR, RAPD-PCR, OUT-PCR ile ev içi PCR tekniğine dayalı olarak değerlendirilmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: 2010 numunenin direkt mikroskopi ve kültür sonuçları analiz edildi. İlaç duyarlılık sonuçları TULSA'dan elde edildi. İzolatların tiplendirilmesi, bir devlet üniversitesinin tıp fakültesinin mikrobiyoloji laboratuvarında, in house PCR yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Pozitif örneklerin %2.68'inde Aside dirençli basil (ARB) pozitif + kültür pozitifliği, yaymada %2.93'ünde ARB pozitif ve kültür negatif, yaymada %1.34'ünde ARB negatif ve kültür pozitifliği vardı. Kültür pozitif olan 33 izolatta primer antitüberküloz (anti-TB) ilaçlara direnç görülmezken, bir veya daha fazla primer anti-TB ilaca direnç %9.09'da gözlendi. Tek ilaç direnci %3.03, Isoniazid (INH) ve INH kritik ilaçlara direnç %6.06 idi. İzolatlar ERIC-PCR ile 3 gruba, OUT-PCR için 5 grup ve RAPD-PCR ile 6 gruba ayrıldı. Sonuç: Çalışılan numune oranının düşük olması, tedavi sürecinde alınan numunelerin negatif olması nedeniyle pozitiflik oranları düşüktü. ERIC-PCR, RAPD-PCR ve OUT-PCR gibi moleküler teknikler, kökenler arasındaki farklılıkları, benzerlikleri değerlendirmede Mycobacterium tuberculosis'in (MTB) epidemiyolojik tiplendirilmesi için kolay, hızlı ve ucuz yöntemlerdir.