Mesoamérica es considerada el centro de origen y diversidad del maíz (Zea mays L.). La teoría multicéntrica del origen y diversidad del maíz define cinco centros de origen-domesticación, a partir de los cuales se conformaron cuatro macro regiones o centros de diversificación primaria de este cereal, de donde fueron emergiendo las diversas razas y la concentración de su diversidad. Un centro de diversidad genética se define como aquella área geográfica donde existe diversidad morfológica, genética, o ambas, para una determinada especie, que se caracteriza por albergar poblaciones de los parientes silvestres y que constituye una reserva genética. El objetivo de este estudio fue validar de manera empírica las regiones geográficas de México que conforman con la definición de centro de diversidad genética para el caso del maíz. Se utilizó análisis espacial para examinar la diversidad y distribución de 24,126 colectas de maíz nativo y 1,106 registros de parientes silvestres (Teocintle: 692 y Tripsacum: 414) colectadas durante el periodo 1926-2014, disponibles en los bancos de germoplasma y herbarios de las instituciones de investigación y enseñanza agrícola nacionales e internacionales ubicados en México y, mediante el uso de sistemas de información geográfica y modelación. En apego a los criterios y definiciones considerados en la teoría multicéntrica de origen y diversidad del maíz, se definieron y validaron empíricamente 19 regiones geográficas que se consideran centros de diversidad genética del maíz nativo de México.