No abstract

No abstract

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ГОСПИТАЛЬНЫХ ШТАММОВ STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS, ВЫДЕЛЕННЫХ У НОВОРОЖДЕННЫХ ОТДЕЛЕНИЯ РЕАНИМАЦИИ И ИНТЕНСИВНОЙ ТЕРАПИИStaphylococcus epidermidis -представитель нормальной микрофлоры человека, способный вызывать опасные за-болевания у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела при рождении. Различные штаммы S. epidermidis обладают разным спектром генов, ассоциированных с их резистентностью к антимикробным препа-ратам и патогенностью. По результатам анализа данных полных геномных секвенирований четырнадцати штаммов S. epidermidis изучено генетическое разнообразие штаммов, циркулирующих в отделении реанимации и интенсивной терапии новорожденных НЦАГиП им. В. И. Кулакова. Выявлена принадлежность штаммов к восьми сиквенс-типам, из которых чаще встречались ST2 и ST59, принадлежащие к единому клональному комплексу СС2. К данному кло-нальному комплексу относились 10 из 14 штаммов. Показано, что изученные штаммы обладали широким спектром генов резистентности к антимикробным препаратам. Обнаружено 15 различных генов, обуславливающих резистент-ность штаммов к аминогликозидам, бета-лактамным антибиотикам, фузидиевой кислоте, макролидам, линкозамидам, стрептограмину B, тетрациклину и триметоприму. Выявлены гены, ассоциированные с патогенностью (aae, atlE, aap, embp), встречающиеся в геномах изученных штаммов с разной частотой. В геномах девяти штаммов был обнаружен инсерционный элемент IS256, а в геномах семи штаммов -гены ica-оперона, отвечающего за синтез белков матрикса биопленок.Ключевые слова: полиморфизм, полногеномное секвенирование, патогенность, резистентность, Staphylococcus epidermidis, новорожденные, сиквенс-тип GENETIC POLYMORPHISM OF STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS STRAINS IN PATIENTS OF THE NEONATAL INTENSIVE CARE UNITStaphylococcus epidermidis is a member of the normal bacterial flora of humans capable of causing potentially dangerous diseases in neonates with very or extremely low birth weight. The number of genes responsible for virulence and antibiotic resistance may vary in different S. epidermidis strains. We sequenced isolates of S. epidermidis to explore genetic diversity of 14 strains circulating in the Neonatal Intensive Care Unit of Kulakov Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology. Among the studied strains, 8 sequence types were identified, the most frequent being ST2 and ST59, both of which belong to the clonal complex CC2. Of 14 studied strains, 10 were of CC2 type. The studied strains revealed a variety of genes responsible for antibiotic resistance. We found 15 genes that provided resistance to aminoglycosides, beta-lactam antibiotics, fusidic acid, macrolides, lincosamides, streptogramin B, tetracycline, and trimethoprim. We identified a number of genes associated with virulence (aae, atlE, aap, embp), whose frequency in the studied isolates was varied. The insertion element IS256 was detected in 9 strains, and 7 strains revealed the presence of the ica-operon responsible for the biosynthesis of the biofilm matrix proteins.

No abstract

The expression of immune response gene mRNA in the umbilical and venous blood were compared in newborns of the first day of life with and without signs of infection. The expression of il1b, il6, il8, il10, il12a, il15, il18, tnfa, tgfb1, tbx21, gata3, foxp3, rorc2, cd45, cd68, cd69, tlr2, tlr4, tlr9, and mmp8 mRNA was evaluated in umbilical and venous blood cells of newborns by reverse transcription real time PCR. In full-term newborns without signs of infection, the expression of il8, tlr2, tlr4, and mmp8 in venous blood was higher than in umbilical blood, while in preterm newborns, the levels of mmp8 transcript were elevated while the levels of tlr9, cd45, and gata3 were reduced. The expression of some markers differed in the umbilical and venous blood and in newborns with congenital infectious disease and without signs of infection.