Эволюции ювенильного анкилозирующего спондилоартрита свойственно в последующем более частое вовлечение в патологический процесс локтевых и голеностопных суставов, развитие энтезопатий, изменений интраартикулярных рогов менисков, формирование кист Бейкера, хондромных тел и системного остеопороза, а сумма значимости перечисленных признаков превышает аналогичную у пациентов с дебютом болезни во взрослом возрасте в 13 раз, но при этом для ювенильного анкилозирующего спондилоартрита менее характерно поражение позвоночника. Наблюдается возрастной диморфизм результатов использования отдельных групп медикаментозных препаратов и физиотерапевтических средств.