Uma das maiores preocupações da área de saúde pública são causadas pelos parasitos intestinais humanos, que são encontrados em grande parte nos países tropicais. O diagnóstico dessas doenças parasitárias se dá por meio de sintomas fisiológicos e exame fecal. Frequentemente, poucos profissionais estão disponíveis e aptos a realizarem esse tipo de exame, que é considerado lento, difícil, propenso a erros e pode causar fadiga ocular no especialista. Portanto, o objetivo desse trabalho é utilizar redes neurais convolucionais para classificar ovos de parasitos intestinais, sendo um sistema de auxílio a tomada de decisão no diagnóstico de um exame de fezes. Foram realizados experimentos empíricos de modo a definir uma arquitetura da rede específica para cada problema. Os resultados obtidos demonstraram uma taxa de reconhecimento de 99.9%, para todas as métricas avaliadas. A aplicação desenvolvida será parte essencial de um futuro sistema totalmente automatizado.