El objetivo del artículo es investigar sobre la incidencia de las variables que componen el Capital Intelectual en el rendimiento financiero de las Instituciones de Educación Superior, específicamente en las universidades de Chile. Fueron investigadas cincuenta y siete universidades entre públicas y privadas, de las cuales se obtuvo ratios financieros y las dimensiones de Capital Intelectual, es decir, Capital Humano, Estructural y Relacional. Los resultados obtenidos apoyan parcialmente las hipótesis planteadas las cuales indican que el Capital Humano, Relacional y Estructural contribuyen al desempeño financiero que tienen las Universidades.