Objetivo. Evaluar el efecto de la ingestión de Banisteriopsis caapi y Psychotria viridis ‘Binomio ayahuasca’ en el hipocampo de cerebro de ratas. Diseño. Estudio experimental, descriptivo, analítico, transversal. Institución. Instituto de Investigación en Ciencias Farmacéuticas y Recursos Naturales, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Lima, Perú. Material biológico. Ratas. Intervenciones. Administración del binomio ayahuasca por vía orogástrica a ratas albinas adultas de la especie Rattus novergicus y de cepa Holtzman. A siete grupos de cinco con un peso promedio de 240 ± 30 g se les administró: (GI) blanco, (GII) 2,5 mL diazepam, (GIII) 0,7 mL solución de Banisteriopsis caapi, (GIV) 0,7 mL Psychotria viridis, y a los grupos (GV), (GVI) y (GVII) se administró 0,7 mL, 3,5 mL y 7,0 mL de solución del binomio ayahuasca, respectivamente. Principales medidas de resultados. Macroscópicos: comportamiento de reflejos y actividad motora. Microscópicos: número de células piramidales y granulosas, y desorganización celular. Resultados. En el tamizaje fitoquímico del extracto se caracterizó presencia de alcaloides, antraquinonas, triterpenoides y esteroides, fenoles, flavonoides y saponinas. Los volúmenes de droga administradas a los grupos de intervención con el binomio en la dosis de 0,7 mL manifestaron significativo aumento en el número de células granulosas sobre las células piramidales; a dosis de 3,5 mL el número de células granulosas fue menor con presencia de células piramidales grandes y pequeñas; y a dosis de 7,0 mL se manifestó desorganización celular, presencia de células piramidales grandes y pequeñas, y aumento de células granulosas. Conclusiones. El extracto alcohólico del binomio ayahuasca presenta efecto neuropatológico en el hipocampo del cerebro de ratas.