В обзоре проанализированы новейшие данные о разнообразии эндогенных ретровирусов птиц, исследована их структура, особенности экспрессии и возможные пути эволюции. Обсуждается роль эндогенных ретровирусов в онтогенезе и возникновении патологий. Название Предполагаемая структура Число на гаплоидный геном Размер, тыс. п. н. ALV-родственные провирусы (ev) 0-10-7,7 ev-1,2 LTR-gag-pol-env-LTR ev-3 LTR-Agag-Apol-env-LTR ev-4 gag-pol-env-LTR ev-5, 6 pol-env-LTR ev-7,8 LTR-gag-pol-env-LTR ev-9 ?LTR-?gag-pol-env-LTR ev-10, 11, 12 LTR-gag-pol-env-LTR ev-13 0 ev-14 LTR-gag-pol-env-LTR ev-15, 16 LTR
При помощи полимеразной цепной реакции и метода полиморфизма длины рестрикционных фрагментов охарактеризованы ALV-родственные ретровирусы (семейство ev) в ДНК инбредной линии кур СВ (ВJ2/В12), устойчивой к RSV-индуцированному онкогенезу. Обнаруженные провирусы (ev-1, ev-7, ev-10) могут отвечать за продуцирование инфекционных и неинфекционных вирионов. Установлено, что провирусы интегрированы преимущественно в GC-богатые участки генома (51-62 % ОС).
The distribution of seven groups of endogenous retroviruses (ALV-related ev loci, HERV-I-related proviruses, EAV-HP, EAV-0, E-33, E-51, ART-CH) in the genome of domestic chicken (Gallus gallus) was studied according to the composition (long-range variation of GC-content) of the host genome. GC-rich proviruses (ev loci, ART-CH and EAV-0) have been localized mainly in GC-richest isochore families H2, H3 and H4, GC-poor HERV-I-related proviruses, E-51 and E-33 localized in GC-poor isochore families LI, L2 and also in HI (isopycnicity). GC-rich EAV-HP, except expected distribution GC-rich isochores, present also in GC-poor compartments. Investigation of expression by RT-PCR and analysis of EST databases provided a tissue-specific patterns that could change the picture of proviral distribution due to reintegration. Reasons of endogenous retrovirus isopycnicity are likely to be the compositional match between the integrant and the chromosomal region of the host, that led to the stability of integration.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.