Para la evaluación de la actividad citotóxica de las especies Conyza trihecatactis y Ageratina vacciniaefolia pertenecientes a la familia Asteareaceae, se recolectaron las partes aéreas de las especies y se obtuvieron extractos completos etanólicos y fracciones con solventes en orden creciente de polaridad. La evaluación de la actividad citotóxica se realizó por el método del MTT sobre líneas celulares tumorales de cáncer de seno murino y humano, y adicionalmente, sobre una línea no tumorigénica de fibroblastos de origen murino. La fracción de diclorometano de C. trihecatactis (CD) presentó la mayor actividad citotóxica con una CI50 de 36,23 µg/mL para 4T1, 47,81 µg/mL para TSA, 46,05 µg/mL para MCF-7 y 70,67 µg/mL en fibroblastos 3T3. A partir de esta fracción se obtuvo una mezcla de flavonoides (CMF), identificados como apigenina e hispidulina, que presentó un marcado efecto citotóxico sobre MCF-7 con una CI50 de 23,50 mg/mL. Las fracciones obtenidas a partir de A. vacciniaefolia presentaron CI50 mayores a 150 µg/mL en las líneas tumorales evaluadas y superior a 180 µg/mL en la línea de fibroblastos 3T3. En la fracción de cloroformo de A. vacciniaefolia (AC) se identificaron cuatro compuestos de tipo terpenoide, que presentaron similitud en el tiempo de retención (tret) y en el espectro de masas con los compuestos aislados e identificados en estudios previos para esta especie.