No abstract

Bất dục đực bào chất (cytoplasmic male sterility, CMS) là một tính trạng di truyền làm mất chức năng của hạt phấn. Đây là một trong những tính trạng quan trọng trong sản xuất hạt giống lai. Đối với giống lai ớt cay thương mại, thời gian nhận diện các dòng ớt bất dục đực bào chất bằng phương pháp truyền thống mất nhiều thời gian. Do đó, các marker phân tử đang được phát triển để khắc phục khó khăn này. Với mục đích phát hiện các dòng ớt bất dục đực tại Việt Nam bằng marker phân tử, chúng tôi tiến hành phân tích dữ liệu từ các công trình nghiên cứu trong và ngoài nước. Kết quả phân tích cho thấy, để có thể nhận diện chính xác dòng ớt CMS cần sử dụng kết hợp hai yếu tố: (1) yếu tố nhận diện bào chất S và bào chất N, và (2) yếu tố nhận diện gene Rf và fr. Mỗi yếu tố có nhiều loại marker khác nhau được phát hiện. Bài báo này sẽ giúp cung cấp cơ sở khoa học để chọn lựa các marker tiềm năng và phù hợp với điều kiện hiện tại ở Việt Nam trong phát hiện dòng ớt CMS. Ngoài ra, mồi cần thiết cho phản ứng PCR để nhận diện dòng ớt CMS đã được xác định để làm cơ sở cho các nghiên cứu thực nghiệm sau này

Thoái hóa khớp (THK) là dạng viêm khớp phổ biến nhất và là một trong những nguyên nhân chính gây ra các cơn đau ở khớp, làm giảm khả năng vận động và có thể dẫn đến tàn phế ở người. Chẩn đoán sớm THK là yếu tố quan trọng giúp cho việc điều trị bệnh hiệu quả. Tuy nhiên, các phương pháp chẩn đoán hiện nay không đủ nhạy để phát hiện các thay đổi trong giai đoạn sớm của bệnh. Vì vậy, việc tìm ra các dấu chứng sinh học (biomarker) có thể giúp phát hiện THK ở giai đoạn đầu cũng như theo dõi tiến triển của bệnh là rất cần thiết. Các nghiên cứu hiện nay đang chú ý đến phân tử microRNA (miRNA) tuần hoàn (circulating miRNA) nhờ các ưu điểm: không bị phân hủy bởi RNase, chịu được điều kiện khắc nghiệt (nhiệt độ cao, pH rất thấp hoặc rất cao), lưu trữ trong thời gian dài, chịu được việc đông lạnh-rã đông nhiều lần và lấy mẫu không cần phương pháp xâm lấn. Nhiều nghiên cứu đã cho thấy tiềm năng sử dụng miRNA tuần hoàn trong chẩn đoán sớm THK trong lâm sàng. Từ đó, chúng tôi tiến hành tổng hợp các dữ liệu nghiên cứu về miRNA tuần hoàn trong THK, làm cơ sở lý thuyết cho các nghiên cứu thực nghiệm sau này ở Việt Nam.

MicroRNA là một phân tử RNA nhỏ kích (thước khoảng 20 - 25 nucleotide) không tham gia mã hóa, có chức năng điều chỉnh biểu hiện gene bằng cách ức chế phiên mã hoặc dịch mã. Những năm gần đây, thoái hóa khớp được xem là nguyên nhân xếp thứ hai dẫn đến tăng số lượng người sống cùng với tàn tật. Với sự già hóa dân số thế giới nói chung và Việt Nam nói riêng, thoái hóa khớp là một thách thức lớn trong việc chẩn đoán và điều trị ở giai đoạn sớm. MiR-144-3p là một trong những phân tử đã được chứng minh có chức năng trong bệnh thoái hóa khớp. Tuy nhiên, mạng lưới tương tác của microRNA với hệ thống gen đích trong một điều kiện bệnh là vô cùng phức tạp. Để chức năng của phân tử miR-144-3p được hoàn chỉnh, cần từng bước xác định chức năng trong điều kiện bệnh thoái hóa khớp đối với gen đích tiềm năng nhất định. Gen đích của miR-144-3p đã được dự đoán bằng các công cụ như Target Scan Human, miRDB và miRmap. Kết quả dự đoán cho thấy THBS1 được xác định là gen đích của miR-144-3p với 04 vị trí bắt cặp và có chức năng liên quan bệnh thoái hóa khớp thông qua con đường tín hiệu TGF-β.

MicroRNAs are short endogenous non-coding RNA molecules, typically 19-25 nucleotides in length, which negatively regulate gene expression through binding to 3’UTR of target mRNAs, leading to repression of protein translation or target mRNA degradation. MicroRNA-144 (miR-144) was found as an abnormal expression in various diseases, including osteoarthritis (OA). We have identified increased microRNA-144 expression in early phase and end stage of OA. However, the molecular mechanism of this increase has not been yet to be determined yet. Using bioinformatics tools, we found more than 4,000 mRNAs that are predicted to be potential direct targets of miR-144, including mRNAs involved in the critical signaling pathways in OA e.g. TGFβ/Smad2/3 and WNT/β-catenin. Results from this research provide information for future ex periments to validate miR-144 potential targets.