Se realizó una investigación observacional, descriptiva y de corte transversal; con la participación de 492 alumnos con edades comprendidas entre 6 y 12 años, matriculados en centros escolares primarios de la parroquia Alangasí, provincia de Pichincha y de la parroquia Puerto Baquerizo Moreno en la ciudad de San Cristóbal, Islas Galápagos, Ecuador; cuyos tutores legales dieron el respectivo consentimiento. El Sistema Internacional para la Detección y Evaluación de Caries (ICDAS) se utilizó para evaluar el estado de los primeros molares (16, 26, 36 y 46). Entre la población de estudio predominó la presencia del género femenino, además de la categoría que implican lesiones de caries en esmalte dental o en la de sano. Atendiendo a las medias, se apreció mayor afectación en los primeros molares de los participantes de Quito (1,51-2,37) en comparación con los de San Cristóbal (1,18-1,46); no observándose diferencias importantes atendiendo al género. Sin embargo, durante el análisis de los datos entre tipos de colegio se halló que la población de la escuela fiscal tenía más afectación (1,91-2,37). Además, hubo asociaciones entre categorías de las variables involucradas.