Abstract. Building a rich internet application (RIA) requires the programming of various callbacks and listeners. AJAX like server requests require callback handler objects that react to the asynchronous server response. Active Graphical User Interface (GUI) elements like buttons or menu entries require action handlers. Using a timer queue requires appropriate event handlers, too. Programming all these handlers is tedious and error prone. Subsequent steps of e.g. initialization or of a protocol of server requests are scattered over multiple separated blocks of code. The control flow between these blocks is hard to retrieve. Some common variables have to be introduced in order to pass the application state between the different handler blocks. To overcome these problems, we propose to use an extension of UML statecharts, called Action Charts, dedicated to the modeling of callbacks and listeners. All kinds of handlers are modeled in a common uniform statechart notation. States become actions or handlers. Transitions represent the flow of execution. Variables are shared between actions providing a simple mechanism for passing the application state from one handler to the next. From such Action Charts we generate sourcecode that is compliant with the Google Web Toolkit 1 (GWT). The generated code is pure Java code that facilitates validation and debugging of the modeled behavior. It can be translated to JavaScript and run inside the web browser using the GWT crosscompiler. The Action Charts and code generation are implemented as part of the open source CASE tool Fujaba.

Originally, model versioning has been developed to enable teams of developers to work on common model data, concurrently. We have the idea to use the same techniques to facilitate the collaboration of collaboration applications. Multi threaded applications share a common main memory. Thus, all threads have access to the full data structures and each thread may query and update the data structures, concurrently, in order to fulfill its tasks. In distributed applications, each distributed process has access only to its own share of the data model. In order to query and update remote data structure parts, the process has to send an appropriate request to the process, that owns that data. Transferring complex data structures, e.g. as query result, from one process to the other requires tedious data serialization and deserialization mechanisms. To overcome these problems, this paper proposes to replicate model data for each process and to use model versioning techniques to synchronize the different model data replicas. We have built a web based workflow editor and a web based version of a Ludo game to validate this idea. This paper reports about our experiences with the data replication approach and our experiences in using it for web applications.

No abstract

Die Fähigkeit der spezifischen und kontextabhängigen zellulären Adaption auf intrinsische und/oder extrinsische Signale ist das Fundament zellulärer Homöostase. Verschiedene Signale werden von Membranrezeptoren oder intrazellulären Rezeptoren erkannt und ermöglichen die molekulare Anpassung zellulärer Prozesse. Komplexe, ineinandergreifende Proteinnetzwerke sind dabei elementar in der Regulation der Zelle. Proteine und deren Funktionen werden dabei nach Bedarf reguliert und unterliegen einem ständigen proteolytischen Umsatz. Die stimulusabhängige Gentranskription und/oder Proteintranslation nimmt hier eine zentrale Stellung ein, da die zugrundeliegende Maschinerie die Komposition und Funktion der Proteinnetzwerke entsprechend anpassen kann. Zusätzlich zur Regulation der Proteinabundanz werden Proteine posttranslational modifiziert, um deren Eigenschaften rasch zu ändern. Zu posttranslationalen Modifikationen zählen die Ubiquitinierung und/oder Phosphorylierung, welche die Proteinfunktionen hochdynamisch regulieren. Deregulierte Proteinnetzwerke werden oft mit Neurodegeneration und Autoimmun- oder Krebserkrankungen assoziiert. Auch Infektionen mit humanpathogenen Bakterien greifen stark in den Regulierungsprozess von Proteinnetzwerken und deren Funktionen ein. Die zelluläre Homöostase wird dadurch herausgefordert. Bakterien der Gattung Salmonella sind zoonotische, gramnegative, fakultativ intrazelluläre Pathogene, welche weltweit millionenfach Salmonellen-erkrankungen hervorrufen. Von besonderer Bedeutung ist dabei Salmonella enterica serovar Typhimurium (hiernach Salmonella), welches im Menschen, meist durch mangelnde Hygienemaßnahmen, Gastroenteritis auslöst. Immunität in Epithelzellen wird über das angeborene Immunsystem vermittelt und dient der Pathogenerkennung und -bekämpfung. Die Toll-like Rezeptoren (TLR) gehören zu den Mustererkennungsrezeptoren (pattern recognition receptors), welche spezifische mikrobielle Strukturen detektieren und eine kontextabhängige zelluläre Antwort generieren. Danger-Rezeptoren erkennen hingegen nicht direkt das Pathogen, sondern zelluläre Perturbationen, welche durch Zellschäden oder bakterielle Invasionen verursacht werden. Die intrinsische Fähigkeit der Wirtszelle, sich gegen Infektionen/Gefahren zu wehren wird dabei als zellautonome Immunität bezeichnet. Dabei nehmen induzierte proinflammatorische Signalwege und zelluläre Stressantworten eine wichtige Stellung ein. Die zelluläre Stressantwort aktiviert unter anderem die selektive Autophagie. Diese kann spezifisch aberrante Organelle, Proteine und invasive Pathogene abbauen. Ein weiterer Stresssignalweg ist die integrated stress response (ISR), welche eine selektive Proteintranslation erlaubt und damit die Auflösung des proteintoxischen Stresses ermöglicht. Zur Penetration von Epithelzellen benötigt Salmonella ein komplexes System an Virulenzfaktoren, welches die bakterielle Internalisierung und Proliferation in der Wirtszelle ermöglicht. Salmonella nutzt dazu ein Typ-III-Sekretionssystem. Das System sekretiert bakterielle Virulenzfaktoren in die Zelle, sodass eine hochspezifische Modulierung des Wirtes erzwungen wird. Die Virulenzfaktoren SopE und SopE2 spielen dabei eine Schlüsselrolle, da sie die Pathogenität von Salmonella maßgeblich vermitteln. Durch molekulare Mimikry von Wirts GTP (Guanosintriphosphat) -Austauschfaktoren aktivieren SopE und SopE2 die Rho GTPasen CDC42 und Rac1. GTP-geladenes CDC42 und Rac1 wiederum aktivieren das Aktinzytoskelett und stimulieren die Polymerisierung von Aktinfilamenten über den Arp2/3-Komplex an der Invasionsstelle. Das Pathogen wird dadurch in ein membranumhülltes Vesikel, die sogenannte Salmonella-containing Vakuole (SCV), aufgenommen. Die SCV stellt eine protektive, replikative, intrazelluläre Nische des Pathogens dar und wird permanent durch verschiedene Virulenzfaktoren moduliert. Im Allgemeinen führt die Aktivierung von Mustererkennungsrezeptoren und Danger-Rezeptoren also zu einer zellulären Stressantwort und Entzündungsreaktion, wodurch es zur Bekämpfung der Infektion kommt. Inflammatorische Signalwege werden meist über den zentralen Transkriptionsfaktor NF-κB (nuclear factor 'kappa-light-chain-enhancer' of activated B-cells) vermittelt. NF-κB bewirkt die Induktion von proinflammatorischen Effektoren und Stressgenen. Zellautonome Immunität wird zusätzlich durch antibakterielle Autophagie ermöglicht, wobei Salmonella selektiv über das lysosomale System abgebaut werden. Das bakterielle Typ-III-Sekretionssystem verursacht an einigen wenigen SCVs Membranschäden, sodass Salmonella das Wirtszytosol penetrieren. Zytosolische Bakterien werden dabei spezifisch ubiquitiniert. Dies erlaubt die Erkennung durch die Autophagie-Maschinerie. In der vorliegenden Arbeit wurde die zellautonome Immunität von Epithelzellen während einer akuten Salmonella Infektion durch quantitative Proteomik untersucht...

Abstract. Today's browsers, tools and Internet connections enable the growth of Enterprise Web Applications. These applications are no longer page-based and designed using HTML code. Enterprise Web Applications bring the capabilities and concepts of traditional desktop applications to the browser. We are used to the development of desktop applications for years and have defined our own process to enable the full model-driven development of applications without source code. Using this process and its tools, we are able to define not only data models for traditional applications and generate code out of it. Combined with the story-driven modeling approach, we are able to design the logic of applications using models and generate fully functional code. To use our knowledge and tools as well as our usual process for the development of Enterprise Web Applications, we investigated our process and adapted it to the new needs. As result we propose a new development process that combines the needs of complex software development with the implementation of web user interfaces and control flows between these user interfaces. The process is a guideline to use models and tools for the development of complex Enterprise Web Applications including data model, behaviour and user interface.