Introdução: O Transtorno do Espectro Autista (TEA) designa inúmeras manifestações relacionadas às deficiências na comunicação e interação social. Em virtude da grande inserção desses indivíduos no âmbito universitário, faz-se necessário compreender como esse processo ocorre, assim como quais desafios são vivenciados. Objetivo: Discorrer e elencar os principais desafios no processo de inclusão enfrentados por indivíduos com TEA no âmbito da educação de ensino superior. Métodos: Trata-se de uma revisão integrativa, onde foram realizadas buscas nas bases eletrônicas Scielo, Lilacs, BVS e MedLine, utilizando os descritores de acordo com o DeSC, publicados entre 2017 e 2021. Para compor os resultados foram selecionados sete artigos de acordo com os critérios de inclusão e exclusão previamente estabelecidos. Resultados: Os principais desafios enfrentados por indivíduos com TEA no processo de inclusão são ansiedade, depressão, medo, falta de compreensão por parte do corpo docente, dificuldades em adaptações as metodologias de ensino, dificuldade de socialização, assim como estigma e falta de suporte individualizado, não sendo respeitada as singularidades de cada indivíduo. Conclusão: Mesmo com o crescente número de estudantes com TEA nas universidades, ainda são evidentes as dificuldades enfrentadas, assim como as limitações apresentadas pelas IES para lidarem com esse público, por isso faz-se necessário a adoção de medidas que sejam capazes de priorizar esses indivíduos.