RESUMO. Menores vazões ocorreram junho/julho e maiores em janeiro, fato associado aos períodos de chuvas à montante do rio, que é no verão. Dos dados hidrológicos, a salinidade apresentou maiores variações, com regime totalmente limnético no período chuvoso e polialino no período seco, com valor máximo de 27,35%o. Os nutrientes, principalmente o nitrato, apresentaram maiores quantidades no período chuvoso, quando há maior lixiviação. A biomassa planctônica foi baixa, indicando área pouco produtiva. A produção do fitoplâncton foi maior no período seco, quando a maior transparência da água permitiu maior atividade fotossintética. Foram identificadas 59 espécies fitoplanctônicas, sendo que no período chuvoso houve predomínio de diatomáceas e no período seco de clorofíceas. Dentre as diatomáceas destacaram-se Aulacoseira granulata e Aulacoseira islandica f. curvata e dentre as clorofíceas Dimorphococcus sp e Staurastrum leptocladum.Palavras-chave: Hidrologia, fitoplâncton, estuário, rio Sâo Freancisco ABSTRACT Hydrology and Phytoplankton of the River São Francisco Estuarine System, Northeat Brazil Studies were carried out in the estuary of the River São Francisco, near Brejo Grande town, Sergipe (Brasil), in 1997 and 1998, in order to evaluate the environmntal

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