In this work, we studied the intraspecific polymorphism of pink salmon, Oncorhynchus gorbuscha (Walbaum, 1792), the least genetically explored species among Pacific salmon and one of the central fisheries objects in the Russian Far East. The most urgent task facing Russian fishery science is to determine the proportion of fish from the main reproduction areas in mixed stocks and, based on these data, predict the number of pink salmon returning to these regions for spawning. Due to the unique feature of the species, which evolved into two allochronous lineages, these lineages have been explored independently in parallel. We designed and used here two sets of outlier SNP markers, and this allowed us to reliably distinguish the most northern (Western Kamchatka and the Magadan coast) and the most southern (Iturup Island) regional stocks as well as intermediate stocks from Sakhalin Island and the Mainland coast in both even and odd lineages of pink salmon. In addition, in odd-year lineage, we discovered pronounced genetic differences between early-run and late-run spawners in Sakhalin Island and the proximity of this early spawning form to the mainland stocks. The created baseline covers the main areas of pink salmon reproduction in the Sea of Okhotsk basin and underlies the regional identification of pink salmon in mixed marine stocks.
Изучено генетическое разнообразие популяций нерки Oncorhynchus nerka (Walbaum) из рек Восточной Камчатки и материкового побережья Охотского моря с использованием данных об изменчивости гена цитохрома b (cytb) мтДНК. Проведена оценка значимости различий по нуклеотидным заменам и по частотам гаплотипов между парами исследованных популяций. Выявлены различия между неркой из разных регионов (североохотоморского и беринговоморского), а также между изученными локальностями из одного региона. В то же время показано, что доля межпопуляционной генетической изменчивости относительно умеренная (12,67%), что свидетельствует об относительно небольшом времени дивергенции популяций. Модель распределения частот попарных нуклеотидных различий, полученная для популяций из исследованной части ареала вида, позволяет предположить, что локальности нерки образовались в результате слияния генетически отдаленных, конспецифичных популяций. Возможно, в истории вида происходило разделение его ареала, что способствовало образованию двух генетически независимых (на протяжении многих поколений) линий.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.