2 Российский университет дружбы народов, экологический факультет, Москва 3 Институт теоретической и экспериментальной биофизики, Пущино Каталитическая субъединица теломеразы человека hTERT подвергается альтернативному сплайсингу, что приводит к потере её функций и снижению теломеразной активности. Известно, что в альтернативном сплайсинге мРНК hTERT принимает участие апоптотическая эндонуклеаза EndoG. Нами изучена роль EndoG в регуляции альтернативного сплайсинга мРНК hTERT. Показано, что сверхэкспрессия EndoG в клетках карциномы кишечника CaCo-2, а также обработка клеточных ядер и цитоплазмы рекомбинантной EndoG и инкубация ядер с РНК, расщепленной рекомбинантной EndoG, приводит к повышению уровня варианта с b-делецией. В изолированных клеточных ядрах и трансфицированных клетках альтернативный сплайсинг мРНК hTERT индуцировался 47-членным РНК-олигонуклеотидом. Идентифицирована длинная некодирующая РНК (1157 нуклеотидов), из которой образуется активный 47-членный РНК-олигонуклеотид. Предложен следующий механизм сплайсинга мРНК hTERT: c кодирующей цепи гена hTERT синтезируется пре-мРНК, а с матричной -длинная некодирующая РНК; EndoG вырезает из длинной некодирующей РНК 47-членный олигонуклеотид, комплементарный пре-мРНК hTERT, в месте соединения экзона 8 и интрона 8. Взаимодействие этого олигонуклеотида с пре-мРНК hTERT индуцирует альтернативный сплайсинг.Ключевые слова: EndoG, теломераза, hTERT, альтернативный сплайсинг, CaCo-2 DOI 10.18097/PBMC20166205544 * -адресат для переписки клеток плазмидой pEndoG-GFP или контрольной плазмидой pGFP (обе "InvivoGen", США) проводили с использованием Lipofectamine 2000 ("Invitrogen", США) по протоколу компании производителя. Эффективность трансфекции (обычно 90-100%) оценивали, подсчитывая число GFP-положительных клеток с использованием флуоресцентной микроскопии. Для трансфекции клеток 47-членным РНК-олигонуклеотидом EGPO (EndoG-produced oligonucleotide) или контрольной РНК (табл. 1, "Синтол", Россия) использовали Oligofectamine Reagent ("Invitrogen") по протоколу компании производителя. Для защиты от нуклеаз EGPO и контрольную РНК модифицировали основаниями с фосфоротиоатными связями. Выделение клеточных органелл и обработка рекомбинантной EndoG (recEndoG)Цитоплазму клеток получали согласно [13]. Клетки гомогенизировали на льду при помощи роторного гомогенизатора Ultra-Turrax T25 ("IKA", США) в 300 мкл буфера: 10 мМ HEPES ("Sigma", США), 10 мМ KCl ("Sigma"), 1,5 мM MgCl 2 ("Sigma"), 0,1 мM EGTA ("Sigma"), 0,3% NP-40, ингибитор протеаз (Protease Inhibitor Cocktail Tablets Complete, Mini, "Roche", Швейцария), pH 7,4, и центрифугировали в течение 3 мин при 2000 g и 4°С. Супернатант содержал фракцию цитоплазмы. Клеточные ядра выделяли согласно [14]. Клетки гомогенизировали на льду при помощи роторного гомогенизатора в 300 мкл раствора, содержащего 50 мМ Трис-HCl pH 7,9, 0,25 М сахарозу, 10 мМ CaCl 2 , и центрифугировали (ультрацентрифуга Optima XE, "Beckman Coulter", США) при 70000 g в течение 90 мин в среде, содержащей 2 М сахарозу, 50 мМ Трис-HCl, 10 мМ CaCl 2 , 5 мМ b-мерка...
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.