Existen pocos reportes sobre masas fúngicas intracardiacas, sobretodo en la población pediátrica. Presentamos el caso de un paciente prematuro extremo que, al permanecer hospitalizado desde su nacimiento en una unidad de cuidados intensivos desarrolló masas fúngicas en atrio derecho, las cuales, por su tamaño, ubicación y resistencia al tratamiento médico, necesitaron de exéresis quirúrgica. Por tal motivo, ante la mínima sospecha de candidiasis sistémica en pacientes pediátricos, es mandatorio incluir en los exámenes de desfocalización un ecocardiograma para descartar endocarditis y así evitar el desarrollo de masas fúngicas intracardiacas. Por lo tanto, la detección precoz para un manejo médico oportuno puede evitar el abordaje quirúrgico que se asocia a un alto riesgo de morbimortalidad en pacientes prematuros extremos.