Los hongos se pueden comportar como alergenos, y si la concentración de esporas supera las 2.000 UFC/m3 son un factor de riesgo para la salud. Nuestro objetivo fue aislar esporas de hongos alergenos en una biblioteca. Para ello, se muestrearon 20 áreas, con el aparato Andersen de seis niveles, con cajas de Petri con agar sabouraud. Se aisló un total de 787 colonias, el 90.34% de hongos filamentosos y un 9.66% de levaduras. Los géneros aislados con mayor frecuencia fueron Cladosporium sp. (52.99%) y Penicillium sp. (13.34%), la temperatura y la humedad relativa promedio fueron de 24°C y 50% H. R., respectivamente. Se concluye que la concentración de esporas encontrada estuvo dentro de los límites aceptables de UFC/m3, sin embargo se sugiere mantener ventanas cerradas y hacer una adecuada limpieza de los espacios para evitar futuras complicaciones tanto en la salud de los usuarios como en el deterioro del material bibliográfico.