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Introdução: A espécie Cochlospermum regium (Mart. & Schr.) Pilger é consideravelmente utilizada na medicina popular para o tratamento de doenças infectoparasitárias e carcinogênicas, porém ainda não se tem conhecimento do risco em utiliza-la, sendo necessário avaliações de mutagenicidade. A espécie vegetal Allium cepa tem sido amplamente observada e utilizada para avaliar o potencial de mutagenicidade e citotoxicidade de plantas medicinais e isolados devido sua alta sensibilidade e sua excelente correlação com variados marcadores farmacogenéticos. Com a utilização crescente de plantas medicinais pela população, é de grande importância a avaliação dos efeitos de mutagenicidade e citotoxicidade dessas substâncias para manter a integridade da saúde das pessoas. Objetivo: O objetivo deste trabalho foi de avaliar o potencial mutagênico e citotóxico de diferentes concentrações do extrato de C. regium. Metodologia: Para a análise foi utilizado o sistema teste Allium cepa (Asparaginales, Alliaceae). Para realização da técnica de Allium cepa utilizou-se o protocolo segundo Fieskejo & Grant (1985). Resultados e discussão: O extrato de C. regium, nas concentrações utilizadas, exibiu efeito citotóxico paralisando as células em profáse e não mostrou efeito mutagênico. Conclusão: Concluindo que a planta C. regium utilizada como planta medicinal pela comunidade, apresenta efeito citotóxico, podendo causar efeitos colaterais e maléficos para quem fizer o uso indiscriminado do extrato para o tratamento de alguns tipos de doenças, porém para a confirmação destes efeitos necessita-se de maior investigação.Palavras- chave: Allium cepa, Mutagenicidade, Citotoxicidade, Alterações cromossômicas.