Chlamydia trachomatis (CT) infection is considered as one of the main causes of sexually transmitted diseases (STD). WHO reports that about 130 million new cases of infection with this pathogen occur worldwide each year (Newman et al., 2015). For example, in Mexico, the infection prevalence among women is reported between 3%

The NGmtr primers enabled us to identify N. gonorrhoeae strains with or without reduction of susceptibility to antibiotics. Therefore, this work constitutes a tool that will facilitate the diagnosis of this infection for a low cost and improve patient quality of life.

Objetivo: Evaluar la utilidad de la prueba de qPCR de COBAS® TaqMan® Chlamydia trachomatis (CT) para la detección de cepas circulantes en México. Materiales y Métodos: Estudio descriptivo y transversal. Se analizaron 413 muestras endocervicales por el sistema COBAS® de pacientes con infertilidad, con el diagnóstico de C. trachomatis. que acudieron a la Clínica ETS del Instituto Nacional de Perinatología (INPer) en la Ciudad de México. Las muestras positivas también analizaron por el sistema Abbot Real-time CT / NG, y por PCR de punto final para la detección de plásmido. Las variables de estudio fueron: Infertilidad, diagnóstico de Chlamydia trachomatis, infección por Chlamydia y otras variables. Para determinar la asociación entre la infección por CT y los datos clínicos se utilizó la prueba no paramétrica exacta de Fisher. Un valor p<0.05 fue considerado como significativo. Resultados: De las 413 muestras, 276 pacientes femeninas con infertilidad primaria y 137 de infertilidad secundaria, con edades de 20 a 42 años. La principal causa de infertilidad primaria fue factor endocrino-ovárico y de infertilidad secundaria fue el factor tuboperitoneal. De 22 muestras fueron positivas, una asociación significativa entre la infertilidad por factor tubárico y la infección por C. trachomatis (RR = 2,47 IC95% 1,1-5,5, p <0,05) fue demostrada por la prueba COBAS® TaqMan® CT. De éstas solo 5 fueron identificadas por el sistema Abbott (p <0.011). Conclusión: El sistema de COBAS® TaqMan® CT de Roche Molecular Diagnostic mostró mayor utilidad para identificar las cepas de CT que están circulando en México.