O objetivo do estudo é analisar a eficiência de Unidades Acadêmicas de uma Universidade Federal Brasileira, a partir de indicadores de desempenho utilizados por gestores de Graduação, Pesquisa e Pós-Graduação. A pesquisa é de cunho descritivo, com abordagem quantitativa e coleta dos dados documental. Os dados foram analisados por meio da técnica de análise envoltória de dados (DEA). A avaliação foi censitária, abrangendo as 13 Unidades Acadêmicas da universidade estudada, compreendendo o período de 2014 a 2018. Os principais resultados indicam que as unidades acadêmicas de Educação, Enfermagem, Oceanologia, Engenharia, Direito e Letras foram as mais eficientes quanto ao uso de seus recursos pelos gestores de Graduação e Pesquisa e Pós-Graduação. Os piores resultados ficaram com a Biologia e Medicina. A falta de dados impediu que outras dimensões fossem analisadas. Sugere-se aos gestores de cada unidade acadêmica e das Pró-Reitorias a possibilidade de avaliação de eficiência via disponibilidade de indicadores de avaliação. Além disso, tornar essa análise parte do calendário anual das avaliações institucionais e, a partir delas, definirem diretrizes e estratégias de ação, o que pode contribuir para ampliar a eficiência das unidades acadêmicas.