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La présente étude a été réalisée grâce au concours financier de l'ARES-CCD à travers le projet AquaTox-Bénin et du Programme d'Appui à l'Enseignement Supérieur (PAES) de l'UEMOA à travers le Projet N° P-Z1-IAD-002. RESUME Les retenues d'eau constituent généralement les réceptacles finaux des pesticides agricoles utilisés dans le bassin cotonnier béninois. La présente étude vise à étudier l'état de santé des poissons dans ces milieux à partir des indices biométriques et des paramètres de croissance. Ainsi, des alevins de Oreochromis niloticus y ont été élevés en enclos et en happas durant 50 jours à Batran et à Songhai (témoin). Chez les mâles, les indices gonado-somatique, hépato-somatique et de condition n'ont pas significativement (p>0,05) varié d'une retenue à une autre, de même que l'IGS et l'IHS en happas chez les femelles. Cependant, l'IGS et l'IHS des femelles en enclos sont significativement plus élevés à Batran qu'à Songhai. Mais aussi bien en enclos qu'en happas, l'indice de condition des femelles est supérieur à Songhai qu'à Batran (p<0,05). Dans la retenue d'eau témoin les meilleurs performances de croissance sont obtenues et l'élevage en happas semble meilleur qu'en enclos dans cette retenue. Cependant, à Batran les poissons élevés en enclos ont mieux grandi que ceux des happas. A Songhaï comme à Batran, les indices biométriques sont généralement meilleurs dans les happas que dans les enclos qui exposent probablement plus les poissons aux pesticides piégés dans la vase.