2) ZEAINVENT TRNAVA s.r.o.; ŠM Farský Mlyn 2/6913 Trnava 917 01 Slovakia Abstract Maintaining genetic diversity for crop improvement and improving the quality of genetic resource management is both an inevitable part of nowadays maize breeding. ISSR markers brings the potential of finding a marker system to discriminate Iowa Stiff Stalk Synthetic and Iodent Reid populations of Zea mays, L. and on the base on coefficients of genetic distance and UPGMA grouping appropriate maize genotypes for the best potential for hybridization can be selected. The work presents the potential of ISSR markers in analysis of length polymorphism when a specific ISSR pattern can be used for fast screening of differences among maize genotypes and based of these differences lines can be used in breeding programms in a very specific mode. Key words:breeding, ISSR, Idt population, maize, SSS population Abstrakt Zachovanie genetickej rozmanitosti v šľachtení rastlín a zvyšovanie kvality genetických zdrojov sú nevyhnutnou súčasťou aj súčasného šľachtenia kukurice. ISSR markéry umoţňujú realizovať takúto poţiadavku ako markérovací systém schopný generovať odlišné dĺţkové profily pre Iowa Stiff Stalk Synthetic a Iodent Reid populácie kukurice a na základe koeficientov genetickej vzdialenosti a UPGMA zoskupení vybrať genotypy kukurice poskytujúce najlepší potenciál vo vzájomnom kríţení. V práci je prezentovaná vyuţiteľnosť ISSR markérov pri rýchlom skríningu odlišností jednotlivých línií kukurice a zapojiteľnosť takýchto výsledkov do praktických otázok šľachtenia. 1227 Detailed abstract V práci je analyzovaný potenciál náhodne sa naväzujúcich mikrosatelitných markérov odlíšiť ISS profil línií kukurice siatej patriacich k Iowa Stif Stalk Synthetic a Iodent Reid líniám. Biologický materiál vstupujúci do analýz bol tvorený desiatimi líniami tak, aby boli zastúpené línie s potvrdeným typom, línie v procese šľachtenia a spolu s nimi línia s otáznym typom, ktorú bolo cieľom na základe molekulárnych analýz priradiť vo vetvovom členení k jednej zo skupín. Línia s otáznym genotypom, o ktorej sa predpokladalo, ţe je Idt x SSS poskytovala v rozpore s predpokladom jej pôvodu veľmi dobrý heterózny efekt s SSS líniami. Biologický materiál bol získaný zo Zeainvent Trnava s.r.o., SR. Predpokladaný pôvod, resp. príslušnosť línii do skupín, bol odhadnutý na základe mnohoročných pozorovaní pri výbere šľachtiteľského materiálu, vychádzajúc predovšetkým z rodokmeňov línií. Celková genomická DNA bola izolovaná z čerstvých, zelených listov podľa Protokolu Rogers a Bendich. Analýzy ISSR markérmi boli uskutočnené s celkovo desiatimi prajmermi, z ktorých dva, (CA) 6 GT a GT(CA) 4 , boli vyhodnotené ako markéry s potenciálom odlíšiť SSS a Idt línie a priradiť spornú líniu k jednej zo skupín. Molekulárne analýzy prebehli v dvoch samostatných cykloch. V prvom boli uskutočnené testy schopnosti markérov odlišovať SSS a Idt línie a ich vzájomné zoskupenie vo vetvovom členení na základe Jaccardovho koeficientu genetickej príbuznosti. V týchto analýzach boli zaradené iba ...
Plum species are reported to possess a wide genomic variability and that is why DNA markers are still actual in the characterization of its germlasm. In this study, twentythree genotypes of European plums were assessed for the amplified length based polymorphism among the retrotransposon Cassandra insertions in their genomes. The obtained insertional polymorphism caused by the activity of Cassandra showed regional and pedigree differences in the analysed accessions of European plums. Two primers were used in analysis. The first resulted in the amplification in 203 amplicons and the 86.6 % polymorphism. Two unique fragments were obtained for the Torysa and Podolínec varieties using this primer. The second primer resulted in the amplification in 267 amplicons and 74.2 % polymorphism. Four unique fragments were obtained for the plum varieties Švestka domácí, Čačanská ranná and Elena. Hierarchical cluster analysis divided the analysed accessions into the four main clusters. To show the length polymorphism diferences of the analysed genotypes from Germany, Slovakia and former Yugoslavia more pecisely, the scattergram for them was constructed.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
customersupport@researchsolutions.com
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
This site is protected by reCAPTCHA and the Google Privacy Policy and Terms of Service apply.
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.