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SARS-CoV-2 triggered a worldwide pandemic disease, COVID-19, for which an effective treatment has not yet been settled. Among the most promising targets to fight this disease is SARS-CoV-2 main protease (Mpro), which has been extensively studied in the last few months. There is an urgency for developing effective computational protocols that can help us tackle these key viral proteins. Hence, we have put together a robust and thorough pipeline of in silico protein–ligand characterization methods to address one of the biggest biological problems currently plaguing our world. These methodologies were used to characterize the interaction of SARS-CoV-2 Mpro with an α-ketoamide inhibitor and include details on how to upload, visualize, and manage the three-dimensional structure of the complex and acquire high-quality figures for scientific publications using PyMOL (Protocol 1); perform homology modeling with MODELLER (Protocol 2); perform protein–ligand docking calculations using HADDOCK (Protocol 3); run a virtual screening protocol of a small compound database of SARS-CoV-2 candidate inhibitors with AutoDock 4 and AutoDock Vina (Protocol 4); and, finally, sample the conformational space at the atomic level between SARS-CoV-2 Mpro and the α-ketoamide inhibitor with Molecular Dynamics simulations using GROMACS (Protocol 5). Guidelines for careful data analysis and interpretation are also provided for each Protocol.

Aquando necessário avaliar-se a atitude falsa, como por exemplo a mentira, numa perícia forense, os profissionais que realizam este tipo de trabalho têm limitados os recursos a que podem recorrer. Uma das razões prende-se com o diminuto investimento na investigação na área da avaliação da mentira. Ainda sobre este ponto, avaliar a mentira é uma tarefa extremamente complexa, sendo vários os olhares que um poderá ter para realizar tal ação. Uma possível forma de observar atitudes falsas é a análise da presença de atitudes malinger. No entanto as ferramentas de avaliação a nível psicométrico para esta área são também escassas e pouco elegantes a nível científico. Finalmente, e mais importante, observa-se uma falta de investigação onde as amostras são totalmente forenses. O presente trabalho apresenta uma descrição de uma amostra forense (n = 470) relativamente ao tipo de atitude malinger presente e às características sociodemográficas da mesma. Observam-se alguns pontos de interesse em alguns tipos de características sociais tais como o tipo de habilitação académica ou o tipo de profissão. O tipo de processo jurídico a que os sujeitos em avaliação estão afetos parece ser importante de considerar e finalmente observa-se uma correlação de cerca de 13% em que a inteligência dos sujeitos explica a sua atitude malinger. Mais estudos são necessários. Os dados apresentados neste trabalho são do interesse dos profissionais da especialidade, mas acima de tudo, são acreditados como um passo para se ter uma linha de comparação para investimento científico no futuro na presente área de avaliação forense.

Methods Conclusions Acknowledgements References Aquaporins (AQPs) are integral membrane proteins, whose function is to facilitate the passive transport of water across the plasma membrane of the cell. 1