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Octopus mimus es una especie de importancia pesquera que se distribuye a lo largo del litoral del Pacífico oriental. Con base en datos moleculares se ha evidenciado que su rango geográfico comprende desde el golfo de California y América Central hasta el norte de Chile. Asimismo, se ha reportado que O. mimus presenta baja diversidad y estructura genética debido principalmente a sus fluctuaciones demográficas, a su historia de vida y a la presión selectiva en el Pacífico oriental.Sin embargo, la estructura genética y los procesos evolutivos que influyen en el patrón filogeográfico de O. mimus no han sido revisados mediante marcadores hipervariables. Con la finalidad de evidenciar la estructura genética en O. mimus y sus relaciones filogeográficas en su distribución, en el presente estudio fueron utilizados marcadores microsatélites y la obtención de los resultados fue planteada con relación a tres niveles de resolución para validar la conformación de los dos grupos biogeográficos de O. mimus previamente identificados por otros autores.Los resultados obtenidos en el presente trabajo permitieron confirmar la baja estructura genética pero significativa (P < 0.05) de O. mimus, y se confirmaron los dos grupos biogeográficos (panámico y peruano) de la especie. El promedio de la diversidad genética de O. mimus fue alta con relación a la heterocigosidad observada y la esperada (Ho = 0.714, He = 0.619) y los análisis demográficos, con base en la prueba de Wilcoxon (P < 0.05) y la distribución de las frecuencias alélicas, indicaron la ausencia de cuellos de botella recientes. La construcción de un dendrograma permitió soportar la agrupación poblacional de O. mimus respecto a los dos grupos genéticos que conforman a la especie. La información obtenida será relevante para desarrollar posteriormente estrategias de conservación y un plan de manejo pesquero para O. mimus.