A mi hija Mireia, a Jose y a nuestra familia 5 AgradecimientosEn primer lugar quisiera agradecerle a la Dra. Anna García Ortolá haberme introducido en el mundo de la investigación con la Beca de Colaboración del Ministerio de Educación durante el último curso de la Licenciatura de Ciencias Ambientales y posteriormente tutorando mi trabajo final de carrera.Al Dr. Miguel Rodilla Alamá por creer en mis posibilidades y brindarme la oportunidad de formar parte del Departamento de Ingeniería Hidráulica y Medio Ambiente, al apoyar mi candidatura al Programa Cantera de la Universidad Politécnica de Valencia. Por su confianza en mi y por respetar mis decisiones en todo momento. Los muestreos en el mar no hubieran sido posibles sin su gran dedicación.A la Dra. Silvia Falco y el resto de compañeros que han formado parte de nuestro grupo en el Instituto para la Investigación de Zonas Costeras a lo largo de estos años. Especialmente a Matías y a Mar, nuestros pequeños grumetes, ahora ya no tan pequeños, siempre dispuestos a ayudar.A la Dra. Carmen Cerveró y a Alicio Calabuig, excelentes técnicos y profesionales donde los haya. Por el apoyo técnico siempre que lo he necesitado y sobre todo por su amistad.A todos aquellos compañeros y amigos que han estado ahí compartiendo el día a día, en especial a Vicent, José Andrés, María, Jesús, Javi y Cristina. A Eduardo gracias por echarme un cabo cuando lo he necesitado.A mi marido Jose, a nuestra princesa Mireia y a nuestras familias por estar siempre a nuestro lado. Os quiero.En último lugar quisiera dejar constancia escrita de un deseo: que la defensa de la tesis se convierta en el principio de un largo camino por explorar y no el fin del camino ya explorado. RESUMENLas aguas costeras y estuarinas se caracterizan por una gran variabilidad, espacial y temporal, en sus características hidrológicas, físicas y químicas, que se refleja en la complejidad de la dinámica de sus comunidades fitoplanctónicas. Además, las zonas costeras están sometidas a una elevada presión antrópica, cuyo principal efecto es el aumento de los aportes de nutrientes de origen terrestre a las aguas receptoras, en las que puede llegar a provocar problemas de eutrofización.El objetivo de esta tesis es caracterizar la variabilidad espacial de las comunidades fitoplanctónicas en aguas costeras y de transición caracterizadas por distintas fuentes de entrada de nutrientes. Obtener información sobre el funcionamiento de estos ecosistemas es necesario para orientar las medidas de gestión necesarias para mejorar la calidad de sus aguas.En la presente tesis se realiza la clasificación taxonómica del fitoplancton con el programa CHEMTAX a partir de las concentraciones de pigmentos fotosintéticos halladas por cromatografía líquida de alta resolución en muestras de aguas costeras. Frente a las técnicas tradicionales de microscopía, esta metodología presenta una serie de ventajas entre las que cabe destacar el menor coste, la mayor rapidez y precisión. Además, se realiza una primera aproximación al uso de imágenes de satélit...