O objetivo deste trabalho foi avaliar a contaminação microbiana de núcleos metálicos advindos de três laboratórios da cidade de Feira de Santana, Bahia, além de propor uma solução química efetiva para desinfecção. O grupo controle mostrou uma contaminação de 60%; as amostras tratadas com álcool etílico 70º GL, 26,6%; e aquelas tratadas com glutaraldeído, 13,3%. O método de esterilização utilizando a autoclave promoveu a esterilização das amostras testadas e o álcool e glutaraldeído se comportaram como agentes desinfetantes.