En los periodos de marzo de 2012 a marzo de 2013, y de setiembre del 2013 a agosto del 2014, se determinó la biodiversidad y abundancia de tintínidos y su relación con variables ambientales, en dos áreas marinas de pesca responsable (AMPR) (Puerto Níspero y Paquera) del Golfo de Nicoya, Costa Rica. Para ambas zonas de muestreo se determinó una estacionalidad de los parámetros físico-químicos influenciada por variabilidad climática de la zona, lo cual se evidenció con las diferencias significativas en el tiempo de muestreo. La población de tintínidos reflejó una baja diversidad de especies donde los principales representantes fueron Tintinnopsis parva, T. uruguayensis y Tintinnidium balechi; y su abundancia osciló entre un rango de 0 a 5583 cél L-1. Al correlacionar la abundancia de tintínidos con respecto a las variables ambientales estudiadas en cada sitio de muestreo, se determinó una tendencia a que las interacciones significativas fueran negativas, principalmente entre la abundancia de tintínidos y la concentración de oxígeno disuelto en ambas AMPR. También, al interrelacionar las variables ambientales respecto al comportamiento temporal de la abundancia de tintínidos, se determinó que sí hay una relación entre el aumento en la concentración de los organismos y la variación ambiental. A nivel general, la presencia de tintínidos evidencia el proceso natural de la cadena trófica, al garantizar una dinámica productiva en la base de la cadena alimenticia de las zonas de estudio.