améliorée ces dernières années, confirmée par une récente autorisation pour les activités de conchyliculture à l'aval de l'estuaire. Afin d'améliorer les connaissances du système et d'identifier les leviers d'amélioration de la qualité de l'eau, un modèle numérique tridimensionnel (Télémac 3D) a été mis en place. De nombreuses données ont permis de calibrer le modèle numérique. Dans le cadre de cette étude, une formulation (ERICHSEN et al., 2006) a été implémentée dans le modèle numérique qui permet de calculer le coefficient de dégradation (k) des bactéries en fonction des paramètres principaux ayant une influence sur la mortalité des germes tels que la salinité, la température, la profondeur et l'intensité de la lumière. Pour les scénarios de calibration, les flux de bactéries imposés au modèle sont issus pour la plupart de campagnes de mesures ou d'analyses paramétriques. Des points de mesures à l'aval de l'estuaire, proches des zones d'activités conchylicoles, sont utilisés pour valider le modèle selon les conditions fluvio-maritimes. Plusieurs scénarios sont étudiés afin d'analyser l'impact de chaque source de contamination. Des scénarios de pollutions accidentelles sont également étudiés. Cet article présente la calibration du modèle, la hiérarchisation des flux bactériologiques, une brève analyse sur les impacts et les éventuelles solutions.