High-resolution melting (HRM) analysis was applied to haplotype the Met55Val-Lys62Ala mutations of the Atlantic cod (Gadus morhua) Hb-b1 gene responsible for the important hemoglobin polymorphisms. The Val55-Ala62 haplotype predominated in cod populations throughout the Northwest Atlantic Ocean and the northern Norwegian and Baltic seas, while the Met55-Lys62 variant was mostly found in the North Sea, Kattegat, and along the southern part of the Norwegian coast. Whereas the distribution of the two main haplotypes show a temperature-related north-south gradient in Northeast Atlantic populations, this study provided no evidence for such a cline on the western side of the North Atlantic Ocean. Coupling and repulsion double heterozygotes were readily distinguished by the HRM assay, but no repulsion heterozygote specimens were found on either side of the Atlantic Ocean. The recombinant haplotype Val55-Lys62 was detected in variable numbers in both Northwest and Northeast Atlantic populations, with the highest frequencies in the Canadian populations. The reciprocal Met55-Ala62 recombination was almost absent in the populations examined and probably represents a disadvantage, particularly at elevated temperatures. Our HRM assay affords low-cost, precise, and efficient Hb-b1 polymorphism haplotyping in large numbers of DNA samples in small, moderately equipped laboratories.Résumé : Une analyse de fusion haute résolution (HRM) a servi à déterminer les haplotypes des mutations Met55Val-Lys62Ala du gène Hb-b1 responsable des importants polymorphismes de l'hémoglobine chez la morue franche (Gadus morhua). L'haplotype Val55-Ala62 prédomine dans les populations de morues dans tout le nord-ouest de l'Atlantique et dans le nord de la mer de Norvège et la Baltique, alors que la variante Met55-Lys62 se retrouve principalement dans la mer du Nord, le Cattégat et le long de la partie sud de la côte de la Norvège. Alors que la répartition des deux principaux haplotypes suit un gradient nord-sud relié à la température dans les populations du nord-est de l'Atlantique, notre étude ne fournit aucune indication d'un tel cline du côté ouest de l'Atlantique Nord. L'analyse HRM distingue facilement les hétérozygotes doubles de combinaisons cis et trans, mais aucun hétérozygote de type trans n'a été trouvé sur aucun des côtés de l'Atlantique. L'haplotype recombinant Val55-Lys62 a été détecté en nombres variables à la fois dans les populations du nord-ouest et du nord-est de l'Atlantique, avec les fréquences maximales dans les populations canadiennes. La recombinaison réci-proque Met55-Ala62 est presque absente dans les populations étudiées et représente probablement un désavantage, particulièrement aux températures élevées. Notre analyse HRM fournit une méthode précise, efficace et à bas prix d'haplotypage du polymorphisme Hb-b1 dans un grand nombre d'échantillons d'ADN dans les petits laboratoires moyennement bien équi-pés.[Traduit par la Rédaction]
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