El objetivo del estudio fue estudiar el comportamiento epidemiológico y pérdida económica por equinococosis quística (EQ) en animales faenados en tres mataderos de Andahuaylas (Apurímac, Perú). El estudio se realizó entre octubre y diciembre de 2016 en los mataderos municipales de los distritos de Talavera, Andahuaylas y San Jerónimo. Además, se realizó un estudio retrospectivo, recuperando información de los registros del Formato Epidemiológico de Enfermedades Detectadas en Centros de Beneficio, correspondientes a los años 2011-2016. Entre octubre y diciembre de 2016 el porcentaje de infección por EQ fue de 25.7% (IC95%=24.7-26.7), presentándose los mayores porcentajes en el matadero de Andahuaylas y en la especie porcina (p˂0.05). El porcentaje de infección en el periodo 2011-2016 fue de 30% (IC95%=29.8-30.2), con mayores frecuencias en 2015 y 2016, y en el matadero de Talavera (p˂0.05). La pérdida económica durante los seis años por decomiso de vísceras fue de USD 155,650.