Аннотация. Актуальность и цели. Изучение морфологических, генетических и экологических факторов, объясняющих подразделенную (метапопуляционную) структуру ареалов, является новым и методически слабо разработанным научным направлением. Важной частью таких исследований является изучение генетической структуры популяций животных. Это направление нацелено на решение фундаментальных биологических проблем: целостности биологического вида, микроэволюции и внутривидовой дифференциации, динамики популяций. Цель работы-изучение экологических особенностей генетического полиморфизма лесной (Apodemus uralensis Pallas, 1811), полевой (Apodemus agrarius Pallas, 1771) и желтогорлой (Apodemus flavicollis Melchior, 1834) мышей в Среднем Поволжье на примере Ульяновской области. Материалы и методы. Генетический материал для работы был собран в Ульяновской области в ходе проведения полевых работ в период 2014-2018 гг. Всего было проанализировано 33 последовательности (699 пн) лесных мышей, 14 последовательностей (623 пн) полевых мышей и 9 последовательностей (700 пн) желтогорлых мышей. Для этого были использованы пакеты программ MEGA 7.0.21 и DnaSP 5.10 (Librado, Rozas, 2009; Tamura et al., 2012). Для выявления экологических закономерностей распределения на территории Ульяновской области популяций изученных видов мышевидных грызунов кроме группировок популяций, полученных по данным об их географической близости, были использованы два варианта районирования исследуемого региона-флористическое и эколого-ландшафтное. Результаты. Самый высокий уровень изменчивости митохондриальных фрагментов D-loop был выявлен у A. flavicollis (2.4±0.3 %), тогда как этот показатель для A. uralensis и A. agrarius имеет средние значения (0.8±0.2 % и 0.7±0.2 % соответственно). Анализ выборки секвенсов по географически выделенным группировкам популяций не выявил соответствующую генетическую дифференциацию. Распределение выделенных митотипов по группировкам популяций не имеет какой-либо закономерности. В выборках присутствуют митотипы, обнаруженные только в одной из группировок, и по этой причине они являются специфическими. Такие же результаты были получены и при анализе распределения выявленных митотипов по флористическому районированию Ульяновской области. Распределение выявленных митотипов по ландшафтно-экологическим районам отражает экологические требования изученных видов мышевидных грызунов. Заключение. Полученные результаты свидетельствуют о хорошей разрешающей способности разработанных праймерных систем для амплификации D-loop и изучения популяционного полиморфизма природных популяций, а также для группировки географически разобщенных популяций мышевидных грызунов. Изучение распределения выявленных митотипов всех трех видов мышевидных грызунов по флористическим районам Ульяновской области не выявило какой-либо связи флористической специфичности территорий и рас-ORIGINAL RESEARCH