Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Москва, Российская Федерация;

Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов Цель. Исследование биологических свойств природных штаммов геновариантов V. cholerae биовара El Tor, влияющих на их адаптационные способности в условиях недостатка питательных веществ, при сравнительном анализе с типичными штаммами. Материалы и методы. Конкурентную пробу проводили путем посева смеси клеток двух сравниваемых штаммов в автоклавированную речную воду. Скорость роста штаммов определяли по значению оптической плотности. Экспрессию генов изучали методом ОТ-ПЦР с рассчитанными праймерами и зондами. Результаты. Установлено, что при совместном культивировании типичных штаммов и геновариантов V. cholerae биовара El Tor в условиях недостатка питательных веществ (автоклавированная речная вода) при комнатной температуре уровень выживаемости штаммов геновариантов выше, чем типичных штаммов, что указывает на их выраженные адаптационные преимущества в данных условиях. Показано, что селективные преимущества штаммов геновариантов обеспечиваются более высокой скоростью роста клеток и повышенной экспрессией гена rpoS. Заключение. Получены новые данные о способности бактерий штаммов геновариантов V. cholerae биовара El Tor в отличие от типичных изолятов к быстрому росту и повышенной экспрессии глобального регулятора стрессового ответа гена rpoS, что, возможно, способствует их лучшей адаптации не только в условиях недостатка питательных веществ, но при действии других стрессовых факторов.

No abstract

раЗраБотка и иСпЫтание метода вЫявления рнк вируСа лаССа на оСнове полимераЗной цепной реакции С оБратной транСкрипцией в режиме реального времени 1 ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера», Санкт-Петербург, Российская Федерация; 2 ФКУЗ «Противочумный центр», Москва, Российская Федерация; 3 ФКУЗ «Российский научноисследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов, Российская Федерация; 4 Университет им. Гамаль Абдель Насера, Конакри, Гвинейская Республика; 5 ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии», Москва, Российская Федерация; 6 Дальневосточный Федеральный университет, Владивосток, Российская Федерацияцель. разработка метода выявления и количественного анализа (от-пцр в реальном времени) для выявления генетических маркеров вируса ласса -LASV-Fl. материалы и методы. для работы взяты все доступные в базе данных GenBank (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) последовательности вируса ласса, которые были выровнены для идентификации консервативных сайтов с использованием программного пакета BioEdit 7.2.5 (IbisBiosciences, сШа). для апробации разработанного пцр-набора была использована контрольная панель рнк вируса ласса и псевдовирусных частиц, 27 вирусных штаммов, относящихся к различным семействам, а также 37 образцов сывороток крови от пациентов с лихорадочными заболеваниями, отобранных в лечебных учреждениях республики гвинея в 2016-2018 гг., и 55 проб суспензий органов от многососковых мышей. результаты и обсуждение. аналитическая чувствительность метода варьировала от 10 3 до 10 5 копий/мл и имела 96,4 % диагностическую чувствительность, тогда как аналитическая и диагностическая специфичность составляли 100 %. показано, что разработанная методика может быть успешно применена на практике для обнаружения вируса ласса в гвинейской республике, с использованием различных типов материала от мелких млекопитающих, включая цельную кровь и суспензии органов M. natalensis, а также образцы сывороток крови людей, собранных через 3-7 дней после начала заболевания. сделано также предположение, что данный метод может быть использован для штаммов вируса ласса, распространенных не только в гвинее, но и на других эндемичных территориях, но данный факт необходимо подтвердить в дальнейших исследованиях.Ключевые слова: вирус ласса, лихорадка ласса, от-пцр в реальном времени, гвинейская республика.

Objective of the study was to identify the differences in the production of proteins in typical strain and genetically altered variant of V. cholerae O1, biovar El Tor.Materials and methods. Natural strains M1062 (Astrakhan, 1970) and M1509 (Moscow, 2010) were used as model strains in this work. Strains were cultivated on Luria Bertani agar at 37 °C. Electrophoresis was performed in accordance with W.K. Laemmli technique (1970), mass-spectrometric profiling – the method described by A. Shevchenko et al.Results and discussion. Mass-spectrometric scanning of cell lysates of the examined strains showed significant similarity of their proteomes (615 common proteins). The identified differences pertained to high expression of proteins in the strain M1062, participating in biosynthesis of DNA/RNA, included into “purines, pyrimidines, nucleosides” group, as well as regulatory proteins. In M1509 strain, biosynthesis of the proteins responsible for pathogenesis, adaptation under the influence of unfavorable environmental factors, included into “co-factors, vitamins, pigments” group, involved in lipid, carbohydrate, and protein metabolism, cellular processes, as well as proteins-transporters was increased. It has been suggested that the wide dissemination of El Tor genovariants is probably due to enhanced pathogenic and adaptive properties and also to the considerable transformation of cell  metabolism.