1 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, Россия 2 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Институт математики им. С.Л. Соболева Сибирского отделения Российской академии наук», Новосибирск, РоссияНео�ходимост�� изу�ени� микросателлитных локусов пше-ницы�� в перву� о�еред���� о�условлена актуал��ност��� ра�от по вы�влени� полиморфных маркеров дл� у�астков хромосом�� определ��щих хоз�йственно ценные признаки. В насто�щей ра�оте проведено насыщение отдел��ных районов короткого пле�а хромосомы 5B (5BS) м�гкой пшеницы SSr-маркерами�� разра�отанными по данным секвенировани� BAc-к лонов. 130 клонов�� ото�ранных слу�айным о�разом из BAc-�и�лиотеки 5BS�� �ыли секвенированы на платформе ionTorrent и со�раны в контиги с испол��зованием программы Mir A. Характеристики с�орки (n50 = 4 136 п. н.) сравнимы с таковыми дл� с�орок генома пшеницы и родственных видов�� полу�енными в последнее врем��� и приемлемы дл� решени� зада�и идентификации микросателлитных локусов. Дл� вы�в-лени� последовател��ностей ДН�� с повтор��щейс� единицей 2-4 п. н. испол��зовалс� алгоритм�� основанный на свойствах сложностных разложений�� формиру�щихс� в режиме скол��-з�щего окна. �о данным анализа 17 770 контигов о�щей прот�женност��� 25 879 921 п. н.�� разра�отано 113�� 79 и 67 маркеров микросателлитных (SSr) лок усов c повтор��щейс� единицей 2�� 3 и 4 п. н. соответственно. SSr-марк еры с мотивом 3 п. н. �ыли проверены на нулли-тетрасомных лини�х п�той гомеологи�ной группы хромосом сорта пшеницы Чайниз Спринг (cS). Вы �влен 21 маркер�� специфи�ный дл� хромосо-мы 5В. Были локализованы 8 маркеров в дистал��ном районе хромосомы (�ин 5BS6) с испол��зованием серии делеционных линий cS по 5ВS. Д л� 8 и 4 маркеров определена локализаци� в интерстициал��ном районе в �инах 5BS5 и 5BS4 соответствен-но�� один маркер �ыл локализован в прицентромерном �ине. Сравнител��ный анализ распределени� тринуклеотидных микросателлитов по хромосоме 5В пшеницы и у разли�ных видов злаков указывает на пролифераци� и поддержание количественного содержания повтора (AAG)n в процессе эволюции злаков.Ключевые слова: мягкая пшеница; Triticum aestivum; BAC-клоны; IonTorrent; MIRA; микросателлиты; SSR-маркеры; хромосома 5B; (AAG)n. The shortage of polymorphic markers for the regions of wheat chromosomes that encode commercially valuable traits determined the need for studying wheat microsatellite loci. in this work�� SSr markers for individual regions in the short arm of bread wheat chromosome 5B (5BS) were designed based on sequencing data for BAc clones�� and the regions of the corresponding chromosome were saturated with these markers. Totally�� 130 randomly selected BAc clones from the 5BS library were sequenced on the ion Torrent platform and assembled in contigs using Mir A software. The assembly characteristics (n 50 = 4 136 bp) are comparable to the recently obtained data for wheat and relative species and acceptable fo...