На протяжении последних двух тысячелетий микробное сообщество организма человека признавали фундаментальным фактором, определяющим физиологию и па- тологию хозяина. Данный обзор представляет критический анализ результатов исследований микробиома верхних дыхательных путей в педиатрической практике. Отражены актуальные сведения зарубежной и отечественной литературы о микробиоценозе у новорожденных и детей раннего возраста. Рассмотрены этапы формирования микробиоты дыхательных путей в различные периоды детского возраста. Особое внимание уделено набору генов микроорганизмов, который обеспечивает устойчивость к противомикробным препаратам. Таким образом, сегодня одним из наиболее перспективных направлений исследований в медицине является изучение набора генов, ответственных за формирование микробиоты различных локализаций. Исследование микробиома у новорожденных детей позволит реализовать принципы профилактики, персонификации, предиктивности как основные направления современной высокотехнологичной медицины у пациентов данной группы. Over the past two millennia, the microbial community of the human body has been recognized as a fundamental factor determining the physiology and pathology of the host. This review presents a critical analysis of upper airway microbiome research findings in paediatric practice. The current information of foreign and domestic literature on microbiocenosis in newborns and young children is reported. Stages of formation of the microbiota of the respiratory tract in various periods of childhood are reviewed. Particular attention is paid to the set of microbial genes providing resistance to antimicrobial drugs. Thus, one of the most promising fields of research in today’s medicine is the investigation of a set of genes responsible for the formation of microbiota of various localizations. Microbiome analysis would allow the implementation of principles of prevention, personalization, and predictability as the main directions of modern high-tech medicine.