15 STR loci frequencies with mutation rates in the population from Rio Grande do Sul, Southern Brazil

Chula, Fernanda Goulart Lanes; Rodenbusch, Rodrigo; Schumacher, Simone; Grandi, Tarciana; Michelon, Candice Tosi; Gastaldo, André Zoratto; Costi, Cíntia; Carvalho, Bianca A.; Silva, Cláudia Maria Dornelles da

doi:10.1016/j.fsigen.2008.05.006

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“…Also, for autosomal markers, observed and expected heterozygosity and polymorphism information content (PIC) were calculated (Supplementary Table S4). Results obtained in this study are in concordance with previously published size-based data on South Brazil populations [11][12][13]. For Y markers, diversities and haplotypes/haplogroups were estimated and are presented in Supplementary Tables S5 and S6.…”

Section: Str Analysis By Lengthsupporting

confidence: 89%

“…All data based on length was also compared against previously published CE data on individuals from South Brazil and the results showed similarity and concordance to the published data [9][10][11][12][13]. For the dataset in this study, tests for Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) in autosomal loci detected that one locus deviated from expectations: D18S51 (Supplementary Table S3).…”

Section: Str Analysis By Lengthsupporting

confidence: 82%

“…So, although some HWE deviation was observed for the D18S51 locus, we would expect that in a larger population sampling the HWE would not deviate from expected. Deviations were also observed in previous publications [11][12][13] but authors stated that no significance difference was found after Bonferroni correction. Also, for autosomal markers, observed and expected heterozygosity and polymorphism information content (PIC) were calculated (Supplementary Table S4).…”

Section: Str Analysis By Lengthsupporting

confidence: 64%

“…The South region in Brazil, which includes the State of Rio Grande do Sul, is composed of individuals that present a particular and more homogeneous ancestry background when compared to other regions of the country: the majority of subjects with European ancestry (especially Portuguese, Italian, Spanish, and German) and a smaller number of individuals with African and Amerindian ancestry [7]. South Brazil population has been typed and analyzed by different forensic lengthbased STR systems [8][9][10][11][12][13]. However, given the growing applications of NGS in the forensic field, and to better understand the genetic variation in forensically relevant STR loci, sequence-based studies should be performed.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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Genetic analysis of Southern Brazil subjects using the PowerSeq™ AUTO/Y system for short tandem repeat sequencing

Silva

Sawitzki

Scheible

et al. 2018

Forensic Science International: Genetics

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Section: Str Analysis By Lengthsupporting

confidence: 89%

Section: Str Analysis By Lengthsupporting

confidence: 82%

Section: Str Analysis By Lengthsupporting

confidence: 64%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

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Genetic analysis of Southern Brazil subjects using the PowerSeq™ AUTO/Y system for short tandem repeat sequencing

Silva

Sawitzki

Scheible

et al. 2018

Forensic Science International: Genetics

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“…Todos os locos estavam em HWE. Os resultados de distância genética foram consistentes com a descendência europeia da população do Rio Grande do Sul(CHULA et al, 2009). No Distrito Federal, frequências alélicas de 18 locos STR foram obtidas de 915 indivíduos e comparados a outras amostras do Brasil.…”

unclassified

Análise de frequências alélicas de 15 marcadores STR em alunos da Faculdade de Odontologia de Bauru

Frederico¹

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Agradecer é reconhecer a importância de uma pessoa em nossa vida. Para que alguma conquista seja alcançada, a presença de pessoas que estão dispostas a nos ajudar é imprescindível! Portanto, nada mais justo do que reconhecer a grande importância que essas pessoas fizeram em um caminho que foi construído com a ajuda de muitas mãos. Inicialmente, gostaria de agradecer ao Dr. Carlos Ferreira dos Santos, meu orientador e amigo. Tive a grande honra de conhecê-lo e de ser escolhido para ser seu orientando. Com toda a certeza, você deixará seu legado para todos que têm a oportunidade de conviver com você. Se pudesse descrevê-lo em poucas palavras, as escolhidas seriam competência, retidão e generosidade. Sem essa última qualidade, eu não estaria escrevendo essas linhas. Muito obrigado, querido amigo! Dra. Elza Araújo Torres, muito obrigado! Tivemos a oportunidade de trabalhar na mesma instituição no passado, mas trabalhando agora nessa pesquisa pude comprovar sua competência acadêmica. Sem sua presença, esse trabalho não existiria. Seu amor pela área da genética me contagiou e me fez ver um mundo novo. Thiago Dionísio. Tão jovem e tão brilhante. Seu conhecimento e seu companheirismo foram cruciais ao longo da pesquisa. Na reta final, sua liderança orquestrou um belo trabalho em equipe. Muito obrigado! Adriana Calvo. Sempre disposta a ajudar. A Plataforma Brasil, uma ilustre complicação para todo pesquisador, é algo simples nas suas mãos! Muito obrigado pela ajuda e pela presença sempre proativa. Daniel Brozoski, o gringo do laboratório. Sempre calado e com a fala mansa, mas disposto a decifrar programas que seriam cruciais para a análise dos resultados. Muito obrigado! Cinthia Bachir Moises e Weslley Tsutsumida, diretores executivos, CEO-Chief Executive Officer-da empresa Thermo Fisher Brasil, que não pouparam esforços no momento das análises dos resultados obtidos ao longo da pesquisa. Alessandro Alves Pereira, aluno do programa de pós-graduação da ESALQ, Piracicaba e Dra. Maria Imaculada Zucchi, pesquisadora da da Universidade Estadual de Campinas e professora credenciada no programa de pós-graduação da ESALQ, que tiveram a grande disposição de compartilhar seus conhecimentos sobre programas de análises estatísticas de dados de Genética de População. Muito obrigado! Gostaria de agradecer aos funcionários do laboratório de Farmacologia, especialmente à Viviane A. Parisi Santos, pela valiosa ajuda na coleta de saliva dos alunos e na extração de DNA e a todos os funcionários da FOB/USP. Nos anos que estive nessa instituição, percebi que o clima organizacional propicia uma fluidez na equipe que parece trabalhar como uma única grande engrenagem. Obrigado a todos por facilitarem minha vida acadêmica. Agradeço a minha mãe, Zuza, e a meu padrasto, Clodoaldo, por estarem sempre ao meu lado não me deixando em momento algum desistir dessa empreitada e cuidando dos meus filhos nos momentos em que tinha de me dedicar aos estudos. Obrigado Leda e Ricardo que sempre estiveram ao meu lado! Obrigado Valdete por cuidar da minha casa e ...

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Paleogenetical study of pre‐Columbian samples from Pampa Grande (Salta, Argentina)

Carnese

Mendisco

Keyser

et al. 2009

American J Phys Anthropol

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Ancient DNA recovered from 21 individuals excavated from burial sites in the Pampa Grande (PG) region (Salta province) of North-Western Argentina (NWA) was analyzed using various genetic markers (mitochondrial DNA, autosomal STRs, and Y chromosomal STRs). The results were compared to ancient and modern DNA from various populations in the Andean and North Argentinean regions, with the aim of establishing their relationships with PG. The mitochondrial haplogroup frequencies described (11% A, 47% B, and 42% D) presented values comparable to those found for the ancient Andean populations from Peru and San Pedro de Atacama. On the other hand, mitochondrial and Y chromosomal haplotypes were specific to PG, as they did not match any other of the South American populations studied. The described genetic diversity indicates homogeneity in the genetic structure of the ancient Andean populations, which was probably facilitated by the intense exchange network in the Andean zone, in particular among Tiwanaku, San Pedro de Atacama, and NWA. The discovery of haplotypes unique to PG could be due to a loss of genetic diversity caused by recent events affecting the autochthonous populations (establishment of the Inca Empire in the region, colonization by the Europeans).

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15 STR loci frequencies with mutation rates in the population from Rio Grande do Sul, Southern Brazil

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Genetic analysis of Southern Brazil subjects using the PowerSeq™ AUTO/Y system for short tandem repeat sequencing

Genetic analysis of Southern Brazil subjects using the PowerSeq™ AUTO/Y system for short tandem repeat sequencing

Análise de frequências alélicas de 15 marcadores STR em alunos da Faculdade de Odontologia de Bauru

Paleogenetical study of pre‐Columbian samples from Pampa Grande (Salta, Argentina)

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