A phylogenetic study on Scenedesmaceae with the description of a new species of Pectinodesmus and the new genera Verrucodesmus and Chodatodesmus (Chlorophyta, Chlorophyceae).

Abstract

A comparative study of the phylogeny of Scenedesmaceae based on rRNA gene sequences (ITS1/5.8S/ITS2), cell morphology and cell wall ultrastructure resulted in the acceptance of the genus Acutodesmus and the description of the new genera Verrucodesmus and Chodatodesmus. A new species Pectinodesmus holtmannii and 11 new combinations were erected: Chodatodesmus mucronulatus, Verrucodesmus verrucosus, V. parvus, Pectinodesmus pectinatus f. tortuosus, Acutodesmus bajacalifornicus, A. bernardii, A. deserticola, A. dissociatus, A. distendus, A. nygaardii, A. obliquus var. dactylococcoides. It was shown that the new genera Verrucodesmus and two of the Chodatodesmus strains have enlarged ITS2 helices (helix I in Verrucodesmus and helix III in Chodatodesmus). The occurrence of zoospores of Scenedesmaceae in nature was discussed.

Scenedesmus basiliensis R. Chodat in the Scenedesmaceae (Chlorophyta) system

“…В матрицу были также включены последовательности 18S rDNA других штаммов, идентифицированных Э. Хегевальдом как Acutodesmus obliquus (Hegewald, Wolf, 2003;Hegewald et al, 2013) При использовании в качестве запроса полученной последова-тельности 18S rDNA S. basiliensis (ACKU 646-06), BLAST-идентифика-ция показала 100 %-ное совпадение с тремя последовательностями, депонированными в Генбанке под названием "Acutodesmus obliquus": штаммы CCAP 276/46 (ошибочно приведен под номером 279/46, код доступа -FR865738), CCAP 276/7 (FR865737), CCAP 276/3B (FR865719). Примечательно, что штамм CCAP 276/46 был выделен и первоначально идентифицирован E. Хегевальдом как S. obliquus.…”

“…Все девять штаммов, идентичных или почти идентичных S. basiliensis по последовательности 18S rDNA, сос-тавляют молекулярную кладу, интерпретированную как A. obliquus (Hegewald et al, 2013).…”

“…От других видов, составляющих наиболее близкую сестринскую кладу по отношению к кладе «Acutodesmus obliquus» (в частности, A. distendus, A. deserticola) (Hegewald et al, 2013), автентичный штамм S. basiliensis отличается двумя заменами.…”

“…Scenedesmus basiliensis вместе со штаммами, определенными как A. obliquus (включая изолят с террито-рии Украины), относится к одному риботипу по наличию тимина в 470-м сайте матрицы, которая была выравнена по последовательности 18S rDNA штамма CCAP 279/46 (FR865738). Первый риботип соответствует кладе, интерпретируемой как Acutodesmus obliquus (Hegewald et al, 2013 …”

Scenedesmaceae (Chlorophyta, Chlorophyceae) de duas áreas do Pantanal dos Marimbus (Baiano e Remanso), Chapada Diamantina, Estado da Bahia, Brasil

“…Amparado nos dados dos autores acima, Hegewald (2000) propôs novas combinações para o gênero Desmodesmus. Tsarenko em Tsarenko & Petlevanny (2001) Hegewald et al (2013), baseados em estudos em sequências do gene rRNA (ITS1/5.8S/ ITS2), morfologia celular e ultraestrutura da parede de representantes de Scenedesmaceae, descreveram dois novos gêneros na família: Verrucodesmus E. Hegewald e Chodatodesmus E. Hegewald, C. Bock et Krienitz. A família Scenedesmaceae é composta por 30 gêneros, dos quais 13 estão morfologicamente e filogeneticamente bem delimitados (Hegewald et al 2010, Krienitz & Bock 2012. Recentemente o gênero Tetrastrum, anteriormente posicionado em Scenedesmacae por Hegewald et al (2010), foi transferido para Trebouxiophyceae por Bock et al (2013).…”