A Research on The Role of RpoS againts pH Stress and Metals in Escherichia coli

Abstract

Escherichia coli'de alternatif sigma faktörü olarak adlandırılan rpoS (σ 38) asit şoku, açlık stresi, ozmotik stres, oksidatif stres, DNA hasarı ve durağan faza geçiş dahil olmak üzere farklı streslere karşı hücresel cevapta görevli olan genlerin ekspresyonunu kontrol etmektedir. Bu çalışmada Escherichia coli W3110'da rpoS geninin metal ve pH stresi altındaki rolü araştırılmıştır. E. coli BW25113 suşunda mutant olan rpoS geni, P1kc fajı ile yabani tip E. coli W3110'a aktarılmıştır. Yabani tip E. coli W3110 ve rpoS mutant E. coli W3110 suşunda yaşam deneyleri pH 5,5, 7,0 ve 8,5 fosfat tamponunda olmak üzere 3 farklı pH'da plak sayım metodu ile yapılmıştır. 6 farklı metal varlığında (Zn, Ni, Co, Cd, Ag ve Cu) metal stresindeki rolü minimal inhibisyon konsantrasyonu (MİK) ve petri damlatma yöntemi ile belirlenmiştir. Çalışılan tüm pH değerlerinde rpoS mutant suşlarda duyarlılık gözlenmiştir. Kadmiyuma karşı rpoS mutantının direnç gösterdiği belirlenirken, diğer metallerde herhangi bir rolü olmadığı tespit edilmiştir. rpoS geninin rolü, genin tamamlanması yapılarak doğrulaması sağlanmıştır. Bu sonuçlar RpoS alternatif sigma faktörünün kadmiyum metali ile ilişkili genlerin kontrolünde ve pH stresi ile ilişkili genlerde rolü olduğunu göstermektedir.